基于生物信息学探讨胃癌相关基底膜基因及中药预测

目的 探究胃癌患者的基底膜差异基因之间以及与预后的相关性，并预测调控差异基因表达的中药，通过统计分析中药的性味归经、药物分类为中医药治疗胃癌提供理论支持，有利于后续中医药开发及中西医联合治疗策略的制定。方法 下载TCGA数据库中胃癌患者的转录组数据，通过检索文献获取基底膜相关基因并筛选、分析其在胃癌的表达量及共表达情况，并对差异基因进行基因本体（gene ontology，GO）功能富集分析、京都基因与基因组百科全书（Kyoto encyclopedia of genes and genomes，KEGG）通路富集分析和疾病本体（disease ontology，DO）富集分析。通过GEPIA数据库对差异倍数大的基底膜差异基因进行预后分析，再通过CTD数据库查找对基因有调控作用的化学成分。应用COREMINE数据库查找相关中药，并通过古今医案云平台统计高频中药的性味归经、药物分类。结果 共筛选出15个与预后相关的基底膜基因，根据参考文献筛选出45种化学成分，得到高频中药为茶树根、姜皮、干姜、丹参、人参等；药性以平、温为主；药味以甘、苦为主；归经以脾、肺、肝经居多；以补虚药、收涩药、清热药、活血化瘀药、理气药、化痰止咳平喘药为主。结论 通过生物信息学分析得出胃癌相关基底膜基因及对应的高频中药，为治疗胃癌的中药新药开发及中医药理论的微观挖掘提供思路。

Study on stomach adenocarcinoma related basement membrane genes and prediction of traditional Chinese medicine based on bioinformatics