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基于转录组测序的山茱萸次生代谢生物合成相关基因的挖掘
引用本文:朱畇昊,董诚明,郑晓珂,冯卫生,刘孟奇,赵乐.基于转录组测序的山茱萸次生代谢生物合成相关基因的挖掘[J].中国中药杂志,2017,42(2):213-219.
作者姓名:朱畇昊  董诚明  郑晓珂  冯卫生  刘孟奇  赵乐
作者单位:河南中医药大学 药学院 呼吸疾病诊疗与新药研发河南省协同创新中心, 河南 郑州 450046,河南中医药大学 药学院 呼吸疾病诊疗与新药研发河南省协同创新中心, 河南 郑州 450046,河南中医药大学 药学院 呼吸疾病诊疗与新药研发河南省协同创新中心, 河南 郑州 450046,河南中医药大学 药学院 呼吸疾病诊疗与新药研发河南省协同创新中心, 河南 郑州 450046,河南中医药大学 药学院 呼吸疾病诊疗与新药研发河南省协同创新中心, 河南 郑州 450046,河南中医药大学 药学院 呼吸疾病诊疗与新药研发河南省协同创新中心, 河南 郑州 450046
基金项目:2014年度河南中医学院省属高校基本科研业务费专项(2014KYYWF-ZZCX-03)
摘    要:为探讨山茱萸中环烯醚萜等次生代谢产物合成的遗传基础,采用新一代高通量测序技术对其果实进行转录组测序,共获得得96 032条unigenes,平均长度590.53 bp;其中共有35 478条unigene能被NR,Swissprot,COG,GO,KOG,Pfam和KEGG等7个公共数据库注释。通过对注释所得的unigene进行KEGG代谢通路的分析发现,共有84个unigene与环烯醚萜类成分的生物合成有关;487条unigene参与山茱萸其他次生代谢相关物质代谢调控。研究发现,共有153条unigene参与山茱萸次生代谢产物的氧化/羟基化;72条unigene参与次生代谢产物的糖基化。该研究首次对山茱萸转录组进行了分析,并获得了山茱萸环烯醚萜类等次生代谢生物合成相关的候选基因,为山茱萸的分子生物学研究提供了丰富的数据资源,也为后续探讨候选基因的功能奠定了基础。

关 键 词:山茱萸  转录组  次生代谢
收稿时间:2016/8/1 0:00:00
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