基因芯片法对丙型肝炎病毒RNA的基因型分析

目的：制备丙型肝炎病毒(HCV)基因的分型诊断芯片，检测其对丙型肝炎患者血清HCVRNA基因分型诊断的价值。方法：根据HCV 5′端非编码区末端(5′UTR)和C区设计引物和特异性探针，将设计的20条特异性寡核苷酸探针用核苷酸合成仪合成后，配制成50μmol／ml的点样液，用点样仪点到特殊处理的玻片介质上，制成HCV基因分型诊断芯片。收集HCVRNA阳性的丙型肝炎患者血清30份作为实验组，健康人血清30份作为对照组。用荧光定量PCR仪对两组血清进行HCVRNA定量检测，实验组血清HCVRNA含量均大于5()()copies／ml，对照组血清HCVRNA均为阴性。两组血清进行HCVRNA分离纯化、逆转录反应、巢式PCR扩增后，分别用基因芯片与核酸序列测定法进行双盲HCV基因分型检测。结果：实验组血清基因诊断芯片检测均为阳性；基因分型1b型23例，3a型2例，3b型1例，2a型1例，2b型1例，混合型1b 2a1例，1b 3b型1例；核酸序列测定分型1b型25例，3a型2例，3b型1例，2a型1例，2b型1例；两种方法检测的基因分型符合率为93．3％。对照组血清基因芯片检测均阴性。结论：制备的HVC基因诊断芯片可以用于检测血清HCVRNA，并进行基因诊断分型，准确率较高。

To analyze genotype of HCV RNA with gene chip