| 食管鳞状细胞癌差异DNA甲基化位点初筛及异常甲基化谱的构建 |
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| 引用本文： | 徐若冰,薛恒川,王建平,吴亮,王建明.食管鳞状细胞癌差异DNA甲基化位点初筛及异常甲基化谱的构建[J].肿瘤防治研究,2015,42(1):28-31. |
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| 作者姓名： | 徐若冰 薛恒川 王建平 吴亮 王建明 |
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| 作者单位： | 1. 211166 南京，南京医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系；2. 212200 扬中，江苏省扬中市人民医院胸外科；3. 211166 南京，南京医科大学公共卫生
学院社会医学与健康教育学系 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目(81172268);江苏省高校自然科学研究重大项目基金资助(12KJA330001);江苏省高校优势学科建设工程基金项目(PAAD) |
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| 摘 要： | 目的 采用基因芯片技术初筛食管鳞状细胞癌和正常组织间差异DNA甲基化位点，构建特异性食管癌抑癌基因甲基化谱。方法 用Illumina公司450K芯片对食管鳞状细胞癌、癌旁及正常食管黏膜组织行DNA甲基化检测并行对照分析，共分析485 577个位点，按甲基化β差值和差异分值结合Genecards、Intogen等数据库筛选异常高基化位点，对筛选出的差异甲基化基因进一步采用飞行质谱法验证。结果 食管鳞状细胞癌和正常食管黏膜组织间差异显著的位点共33 717个，其中高甲基化位点27 670个，主要分布于基因体和启动子5’非翻译区。结合数据库对基因生物学功能的描述以及文献报道，初步筛选出包含TMEFF2、CDH13、ING2、CASZ1、IQGAP2、ADAMTS9、AIM2、TRIT1、KLF6、EBF3等在内的差异甲基化基因。其中AIM2基因3个CG位点的甲基化频率在病例和对照中的差异均无统计学意义。芯片检测中发现的CASZ1_CpG_5及其周围的多个CG位点在食管鳞状细胞癌组织中均呈现高甲基化状态。 结论 基因芯片技术可用于食管鳞状细胞癌差异甲基化位点的初筛，但构建的抑癌基因异常甲基化谱在应用前尚需进行大样本、多阶段验证。
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| 关 键 词： | 食管鳞状细胞癌 甲基化 抑癌基因 |
| 收稿时间： | 2013-12-02 |
Screening of Differential DNA Methylation Profile and Construction of Aberrant Methylation Panel in Esophageal Squamous Cell Carcinoma |
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| XU Ruobing;XUE Hengchuan;WANG Jianping;WU Liang;WANG Jianming.Screening of Differential DNA Methylation Profile and Construction of Aberrant Methylation Panel in Esophageal Squamous Cell Carcinoma[J].Cancer Research on Prevention and Treatment,2015,42(1):28-31. |
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| Authors: | XU Ruobing;XUE Hengchuan;WANG Jianping;WU Liang;WANG Jianming |
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| Institution: | 1. Department of Epidemiology and Biostatistics, School of Public Health, Nanjing Medical University, Nanjing 211166, China; 2. Department of Thoracic Surgery, People’s Hospital of Yangzhong, Yangzhong 212200, China; 3. Department of Social Medicine and Health Education, School of Public Health, Nanjing Medical University, Nanjing 211166, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Esophagus squamous cell carcinoma(ESCC) Methylation Tumor suppressor gene |
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