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| 利用Fine-tiling aCGH分析TCR基因重排鉴定T细胞白血病克隆 | |
| 引用本文： | 郑海涛,叶铁真,陈少华,杨力建,卢育洪,李扬秋. 利用Fine-tiling aCGH分析TCR基因重排鉴定T细胞白血病克隆[J]. 细胞与分子免疫学杂志, 2011, 27(5): 483-486 |
| 作者姓名： | 郑海涛 叶铁真 陈少华 杨力建 卢育洪 李扬秋 |
| 作者单位： | 1. 暨南大学医学院血液病研究所,广东,广州,510632 2. 广州市妇女儿童医疗中心血液肿瘤科,广东,广州,510632 3. 暨南大学医学院血液病研究所,广东,广州,510632;暨南大学医学院血液病研究所暨南大学再生医学教育部重点实验室,广东,广州,510632 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目，中央高校基本科研业务费专项资金资助项目 |
| 摘 要： | 目的:建立基于分析T细胞受体(TCR)基因重排而确定T细胞-急性淋巴细胞白血病(T-ALL)克隆的新方法,为研究T-ALL中涉及TCR基因位点的染色体易位提供基础。方法:提取1例T-ALL患者外周血单个核细胞(PBMC)的总DNA,利用精细定位的寡核苷酸阵列比较基因组杂交(fine-tiling aCGH)分析样本与对照组基因组DNA的差异,了解不同染色体上可能的断裂点和具体的位点,根据所提供的初步结果,从断裂点涉及的基因序列设计特异引物,采用连接介导PCR(LM-PCR)和序列分析等方法去找出与之发生重排的基因序列。并进一步通过RT-PCR检测TCR基因表达。结果:该例T-ALL患者fine-tiling aCGH结果显示14染色体TCRα/δ基因座出现4个断裂点,分别对应TCR Vδ1、Vδ2、Jδ1和Jδ2基因位点。通过LM-PCR、测序及序列分析,该例T-ALL患者的PBMC中TCR基因涉及Vδ1Dδ2Dδ3 Jδ1、Vδ2Dδ3 Jδ2重排。RT-PCR的结果也验证T-ALL表达该TCR基因重排。结论:结果表明,利用fine-tiling aCGH及LM-PCR技术可以找出TCR基因重排,并且该方法是可靠的,也是发现一些涉及TCR位点的融合基因的一条途径。 |
| 关 键 词： | Fine-tilingaCGH LM-PCR TCR基因重排 |
Analysis of TCR gene rearrangement for identification of T cell leukemia clone by using Fine-tiling aCGH |
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| ZHENG Hai-tao,YE Tie-zhen,CHEN Shao-hua,YANG Li-jian,LU Yu-hong,LI Yang-qiu. Analysis of TCR gene rearrangement for identification of T cell leukemia clone by using Fine-tiling aCGH[J]. Chinese journal of cellular and molecular immunology, 2011, 27(5): 483-486 | |
| Authors: | ZHENG Hai-tao YE Tie-zhen CHEN Shao-hua YANG Li-jian LU Yu-hong LI Yang-qiu |
| Affiliation: | ZHENG Hai-tao1,YE Tie-zhen2,CHEN Shao-hua1,YANG Li-jian1,LU Yu-hong1,LI Yang-qiu1,3 1Institute of Hematology,Medical College,Jinan University,2Department of Hematology and Oncology,Guangzhou Women and Children's Medical Center,3Key Laboratory for Regenerative Medicine of Ministry of Education,Guangzhou 510632,China |
| Abstract: | AIM: To establish a new method which analyzes T cell receptor(TCR) gene rearrangement for identification of T cells acute lymphoblastic leukemia(T-ALL) clone,it will provide the basis for the study of T-ALL including the chromosome translocation involving TCR loci.METHODS: Total DNA was isolated from peripheral blood mononuclear cells(PBMC) of one case with T-ALL.Using the fine-tiling array comparative genomic hybridization(fine-tiling aCGH) to analyze the genomic DNA differences of the case and control gro... |
| Keywords: | Fine-tiling aCGH LM-PCR |
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