| 天津地区结核分枝杆菌可变串联重复序列多态性研究 |
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| 引用本文： | 谢彤,巨韩芳,赵德福,穆成,赵慧,吴振萍,王撷秀. 天津地区结核分枝杆菌可变串联重复序列多态性研究[J]. 天津医药, 2010, 38(11): 940 |
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| 作者姓名： | 谢彤 巨韩芳 赵德福 穆成 赵慧 吴振萍 王撷秀 |
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| 基金项目： | 天津市科委应用基础研究资助项目 |
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| 摘 要： | 目的:分析天津地区流行结核分枝杆菌(MTB)基因组中分布的可变串联重复序列(VNTR)拷贝数目多态性,探讨不同MTB菌株分辨能力强的VNTR基因分型方法.方法:根据VNTR位点PCR扩增产物片段长度分析临床分离的102株MTB菌基因组中22个VNTR位点中重复序列拷贝数目,使用Hunter-Gaston分辨指数(H)评估各个VNTB位点的多态性和VNTR基因分型方法对菌株的综合辨别能力.结果:13个VNTR位点对不同MTB菌株具有较强的分辨能力,其分辨指数达0.9963.其中QUB11b、11a、18、26,MIRU-26、31和Mtub21的多态性较好(H值为0.442～0.699);MIRU-10、27、39、40,QUB1895和ETR-A位点的多态性尚可(H值为0.203～0.316);而MIRU-2、4、16、20、23、24,QUB1451,ETR-B和C的多态性差(H值为0.000～0.150),其中MIRU-2、20、24和QUB1451在北京家族菌株中没有多态性(H=0).结论:选择多态性好的位点组合可以有效地区分不同的MTB北京家族菌株,建立起菌株分辨能力强的VNTR分型方法.
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| 关 键 词： | 分枝杆菌,结核 串联重复序列 基因型 多态现象,遗传 流行病学,分子 天津 |
Polymorphism of Variable-Number Tandem Repeat in Mycobacterium Tuberculosis Strains Isolated from Tianjin |
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| XIE Tong,JU Hanfang,ZHAO Defu,MU Cheng,ZHAO Hui,WU Zhenping,WANG Xiexiu. Polymorphism of Variable-Number Tandem Repeat in Mycobacterium Tuberculosis Strains Isolated from Tianjin[J]. Tianjin Medical Journal, 2010, 38(11): 940 |
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| Authors: | XIE Tong JU Hanfang ZHAO Defu MU Cheng ZHAO Hui WU Zhenping WANG Xiexiu |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Mycobacterium tuberculosis Beijing Genotype variable number tandem repeat Genotyping Molecular Epidemiology |
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