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用理论方法建立memapsin 2蛋白酶的三维结构模型(英文)
引用本文:黄小琴,蒋华良,罗小民,沈竞康,陈凯先,嵇汝运,曹阳,薛红.用理论方法建立memapsin 2蛋白酶的三维结构模型(英文)[J].中国药理学报(英文版),2001(1).
作者姓名:黄小琴  蒋华良  罗小民  沈竞康  陈凯先  嵇汝运  曹阳  薛红
作者单位:中国科学院上海生命科学研究院上海药物研究所,中国科学院上海生命科学研究院上海药物研究所,中国科学院上海生命科学研究院上海药物研究所,中国科学院上海生命科学研究院上海药物研究所,中国科学院上海生命科学研究院上海药物研究所,中国科学院上海生命科学研究院上海药物研究所,苏州大学化学系,香港科学技术大学生物化学系 上海 中国 200031,上海 中国 200031,上海 中国 200031,上海 中国 200031,上海 中国 200031,上海 中国 200031,苏州 中国 215006,香港,中国
基金项目:National Natural Science Foundation of China (№ 29725203),State Key Program of Basic Ressearch of China (№ 1998051115)
摘    要:目的:通过理论方法建立M2蛋白酶的三维结构模型。方法:基于模板进行多重序列联配和结构联配建立M2蛋白酶的初始结构模型,对初始模型进行分子力学和分子动力学优化,用多种评价方法对所得结构进行合理评价。结果:得到了M2蛋白酶的三维结构模型,合理性评价结果表明该结构模型正确,M2蛋白酶的催化活性位点与天冬氨酸蛋白酶相似,区别在于与活性位点相邻的结构域的构象不同。结构保守区α碳原子叠合结果说明M2蛋白酶与其他天冬氨酸蛋白酶具有相同的生物进化来源。结论:M2蛋白酶的结构模型可以为进一步的分子生物学实验提供有益的参考,也可以此模型为基础进行数据库筛选和药物分子设计。

关 键 词:阿尔茨海默病  淀粉样β-蛋白  模板  药物设计

A 3D-structural modei of memapsin 2 protease generated from theoretical study
HUANG Xiao-Qin,JIANG Hua-Liang,LUO Xiao-Min,SHEN Jing-Kang,CHEN Kai-Xian,JI Ru-Yun.A 3D-structural modei of memapsin 2 protease generated from theoretical study[J].Acta Pharmacologica Sinica,2001(1).
Authors:HUANG Xiao-Qin  JIANG Hua-Liang  LUO Xiao-Min  SHEN Jing-Kang  CHEN Kai-Xian  JI Ru-Yun
Abstract:
Keywords:
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