| Alu-反向PCR检测HIV-1整合位点方法的建立 |
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| 引用本文： | 田亚坤,李侗曾,焦艳梅,李娟,画伟,吴昊.Alu-反向PCR检测HIV-1整合位点方法的建立[J].北京医学,2010,32(12):965-968. |
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| 作者姓名： | 田亚坤 李侗曾 焦艳梅 李娟 画伟 吴昊 |
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| 作者单位： | 首都医科大学附属北京佑安医院感染科,100069;首都医科大学附属北京佑安医院感染科,100069;首都医科大学附属北京佑安医院感染科,100069;首都医科大学附属北京佑安医院感染科,100069;首都医科大学附属北京佑安医院感染科,100069;首都医科大学附属北京佑安医院感染科,100069 |
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| 基金项目： | 国家科技重大专项，北京市科委重大项目 |
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| 摘 要： | 目的建立Alu-反向PCR检测整合型HIV-1DNA的实验方法。方法收集18例HIV-1感染者及12例健康者的抗凝血标本,根据整合型HIV-1DNA的特点设计引物,第一轮PCR5’端引物来自于人类保守的Alu序列,3’端引物来自于HIV-1gag序列,扩增片段包含了整合位点上游的人类基因组DNA序列和整合的HIV-1DNA序列。经PstⅠ酶切后进行自身片段环化,以此为模板设计针对HIV-1LTR和gag保守区域引物,进行巢式PCR。结果 16例HIV-1感染者成功扩增出目的片段,12例健康者均为阴性。结论本实验建立的检测整合型HIV-1的方法为进一步研究HIV病毒储藏库机制提供了参考。
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| 关 键 词： | HIV-1 整合型HIV Alu序列 反向PCR |
Detecting HIV-1 integration site by Alu-Inverse PCR |
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| TIAN Ya-kun,LI Tong-zeng,JIAO Yan-mei,et al.Detecting HIV-1 integration site by Alu-Inverse PCR[J].Beijing Medical Journal,2010,32(12):965-968. |
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| Authors: | TIAN Ya-kun LI Tong-zeng JIAO Yan-mei |
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| Institution: | TIAN Ya-kun,LI Tong-zeng,JIAO Yan-mei,et al(Department of Infection Disease,Beijing You'an Hospital,Beijing 100069) |
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| Abstract: | Objective To establish a study method that measure HIV integration DNA.Methods The blood samples were collected from 18 HIV-1 infected patients and 12 healthy people,A pair of primers were designed according to characteristics of human and HIV-1 genome.The first PCR was carried out by the nested 5' primers from conserved sequences of human Alu and 3' primer from HIV-1 gag sequences.The product of the first PCR was representative of both cellular DNA upstream of the integration site and seguneces of integrat... |
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| Keywords: | HIV-1 |
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