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一个新的人NFBD1启动子的鉴定与分析
引用本文:卜友泉,宋方洲,易发平,马永平. 一个新的人NFBD1启动子的鉴定与分析[J]. 医学争鸣, 2007, 28(22): 2020-2024
作者姓名:卜友泉  宋方洲  易发平  马永平
作者单位:重庆医科大学生物化学与分子生物学教研室,临床检验学省部共建教育部重点实验室,重庆,400016;重庆医科大学生物化学与分子生物学教研室,临床检验学省部共建教育部重点实验室,重庆,400016;重庆医科大学生物化学与分子生物学教研室,临床检验学省部共建教育部重点实验室,重庆,400016;重庆医科大学生物化学与分子生物学教研室,临床检验学省部共建教育部重点实验室,重庆,400016
基金项目:国家自然科学基金(30371479);重庆医科大学青年基金(2004-12);国家公派留学基金(2004850010);致谢:感谢日本千叶癌症中心中川原章和尾崎俊文博士在本研究实施过程中的所给予的热情帮助.
摘    要:目的:鉴定分析NFBD1启动子,为进一步研究其转录调控奠定基础.方法:综合应用生物信息学分析和异构体特异性的巢式RT—PCR技术鉴定NFBD1转录起始位点和转录变异体;高保真PCR方法扩增NFBD1基因启动子区域并分别定向克隆入pGL3-basic和pGL3-enhancer载体,构建NFBD1启动子荧光素酶报告基因重组体;荧光素酶分析检测启动子活性;生物信息学方法预测转录因子结合位点.结果:鉴定了一个新的NFBD1转录起始位点和转录变异体,构建了2个含有长度分别为2.5和1.2kb的NFBD1启动子序列的荧光素酶报告基因重组体以及2个相应的含有外源增强子的NFBD1启动子荧光素酶报告基因重组体.启动子活性分析表明,该启动子区域具有启动子活性,且能被外源增强子有效驱动,是一个新的人NFBD1启动子.转录因子结合位点预测分析表明,该启动子区域缺乏典型的CCAAT盒和GC盒,但含有TATA盒以及STAT1,MZF1和MAZ等潜在的转录因子结合位点.结论:鉴定了一个新的NFBD1启动子.

关 键 词:NFBD1  启动区(遗传学)  增强子元件(遗传学)  转录调控
文章编号:1000-2790(2007)22-2020-05
修稿时间:2007-01-30

Identification and analysis of a novel human NFBD1 promoter
BU You-Quan,SONG Fang-Zhou,YI Fa-Ping,MA Yong-Ping. Identification and analysis of a novel human NFBD1 promoter[J]. Negative, 2007, 28(22): 2020-2024
Authors:BU You-Quan  SONG Fang-Zhou  YI Fa-Ping  MA Yong-Ping
Affiliation:Key laboratory of Ministry of Education for Clinical laboratory Diagnostics, Department of Biochemistry and Molecular Biology, Chongqing University of Medical Sciences, Chongqing 400016, China
Abstract:
Keywords:NFBD1
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