云南省边境地区禽流感H5N1亚型病毒基质蛋白2基因进化分析 |
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引用本文: | 肖雪,张文东,段博芳,赵焕云,刘庆亮,胡挺松,邱薇,冯子良,郑颖. 云南省边境地区禽流感H5N1亚型病毒基质蛋白2基因进化分析[J]. 中华预防医学杂志, 2013, 47(6) |
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作者姓名: | 肖雪 张文东 段博芳 赵焕云 刘庆亮 胡挺松 邱薇 冯子良 郑颖 |
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作者单位: | 1. 650201昆明,云南农业大学;云南省动物疫病预防控制中心 2. 云南省动物疫病预防控制中心 3. 昆明市成都军区疾病预防控制中心 |
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基金项目: | 国家公益性行业专项,军队科技计划项目,云南省科技计划项目 |
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摘 要: | 目的 了解2008-2012年云南省边境地区禽流感H5NI亚型病毒基质蛋白2(M2)和离子通道蛋白基因变异特征及遗传进化关系.方法 于2008-2012年采集云南省边境地区(越南、老挝、缅甸与云南省交界处)家禽和野生鸟类棉拭子样品1240份,经H5N1亚型特异性多重RT-PCR检测,对阳性样品病毒M基因进行扩增,克隆至pMD18-T载体测序,获得M2基因序列,并与已知参考毒株序列进行序列比对及系统发育分析.结果 自1240份样品中检出H5N1亚型阳性样品71份,阳性率为5.72%;选择其中的30份阳性样品进行病毒M2基因测序,共获得14种不同序列,存在3个不同进化分支:1.2.1、1.2.2、2,各有5、7、2份.通过基因系统发育分析发现,M2基因与HA基因呈现不同进化关系;M2蛋白涉及表位、金刚烷胺抗性和禽源、人源毒株的关键性氨基酸位点存在替代或突变.结论 2008-2012年期间云南边境H5N1亚型病毒M2基因具有遗传差异,M2基因进化分支1.2.2毒株已成为当地流行的优势毒株.
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关 键 词: | 正粘病毒科 流感病毒A型,H5N1亚型 病毒基质蛋白质类 遗传分析 |
Genetic evolution analysis of matrix protein 2 gene of avian influenza H5N1 viruses from boundary of Yunnan province |
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Abstract: | |
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Keywords: | Orthomyxoviridae Influenza A virus,H5N1 subtype Viral matrix proteins Genetic analysis |
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