| 结膜吸吮线虫巨噬细胞迁移抑制因子的生物信息学分析北大核心CSCD |
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| 引用本文： | 黄琳,莫兴泽,尚战阳,廖德君,谢洪书,杨绚,刘晖.结膜吸吮线虫巨噬细胞迁移抑制因子的生物信息学分析北大核心CSCD[J].中国病原生物学杂志,2022(7):790-795. |
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| 作者姓名： | 黄琳 莫兴泽 尚战阳 廖德君 谢洪书 杨绚 刘晖 |
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| 作者单位： | 1.黔南民族医学高等专科学校558000;2.遵义医科大学寄生虫学教研室; |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(No.81560336,81760373)；贵州省科技厅科技基金,黔科合基础[2020]1Y348；黔南民族医学高等专科学校科研基金资助项目(No.QNYZ201928)。 |
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| 摘 要： | 目的运用生物信息学方法预测分析结膜吸吮线虫MIF蛋白的结构与功能。方法基于结膜吸吮线虫转录组数据库筛选出MIF基因并进行PCR验证;利用在线软件Expasy分析该基因编码Tcp-MIF蛋白的理化性质和亲疏水性;利用HMMTOP version 2.0和SignalP 4.1 server分别预测Tcp-MIF蛋白的跨膜结构域以及信号肽;运用NetPhos、NCBI-Conserved domains、SOPMA、SWISS-MODEL、IEDB在线程序分别预测Tcp-MIF蛋白潜在的磷酸化位点、保守域结构、蛋白二级、三级结构及其抗原表位;对其编码的氨基酸序列进行同源比对,利用MEGA X软件构建系统进化树,通过STRING数据库对其蛋白互作网络进行预测。结果Tcp-MIF基因全长620 bp,开放阅读框为345 bp,编码115个氨基酸;无信号肽和跨膜结构域,蛋白局部亲水性好,有潜在的磷酸化位点和保守域结构,具有α螺旋、β折叠结构和互变异构酶活性。推测其有4个抗原表位,在STRING数据库共鉴定出包括10个基因在内的21个互作关系。结论生物信息学预测结膜吸吮线虫MIF蛋白基因并对其编码蛋白存在潜在的抗原表位区域,具有多个磷酸化位点,可为结膜吸吮线虫感染疫苗的研发提供理论基础。
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| 关 键 词： | 结膜吸吮线虫 MIF 序列分析 功能蛋白 |
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