高尿酸血症患者外周血miRNA表达谱的分析及ceRNA网络构建 |
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作者姓名: | 苟海梅 万霈春 郭伟绮 邓璐 彭元洪 钟晓武 |
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作者单位: | 1. 川北医学院附属医院检验科;2. 川北医学院医学检验系;3. 川北医学院临床医学院;4. 川北医学院转化医学研究中心 |
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摘 要: | 目的:探讨高尿酸血症(HUA)患者外周血miRNA表达谱及ceRNA网络构建。方法:对5例HUA患者及5名体检健康者外周血单个核细胞miRNA表达水平进行检测并测序,筛选出差异表达的miRNA分子。利用miRwalk、miRBD、miRTarBase和targetscan数据库预测miRNA的靶基因;circbank数据库预测circRNA-miRNA的靶向结合关系。通过DAVID和Metascape数据库对靶基因的基因功能和通路富集分析。利用Cytoscape构建主要信号通路的circRNA-miRNA-mRNA调控网络。结果:在HUA患者与体检健康者中,共发现47种已知miRNA和4种新miRNA差异表达,其中已知差异表达miRNA有25种上调,22种下调。差异表达miRNA的靶基因主要富集在癌症和细胞衰老相关信号通路。基于ceRNA理论构建的癌症相关信号通路circRNA-miRNA-mRNA调控网络,涉及96个circRNA节点、13个miRNA节点及212个mRNA节点。结论:HUA患者外周血miRNA表达谱与健康体检者存在差异,且差异表达miRNA靶基因与癌症的发生发展密切...
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关 键 词: | 高尿酸血症 miRNA ceRNA miRNA测序 |
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