2018年广州市输入型登革病毒3型基因组全序列测定和特征分析

目的 分析广州市2018年输入型登革热病毒3型（DENV - III）毒生物学来源，为本地登革热防控提供科学依据和基线数据。方法 通过传染病监测网络收集广州市2018年输入型DENV - Ⅲ病例，对患者急性期血清进行病毒分离培养、全基因组测序、系统发生树重建和生物信息学分析。结果 共分离到4株DENV - Ⅲ型毒株，株间核苷酸（氨基酸）同源性为91.8%～97.3%（97.6%～99.4%）；泰国输入的分离株属于G - I型，与印度尼西亚2016年分离株的距离最近；其余3株分离株属于G - Ⅲ型，在进化树上处于同一分支，分别与老挝、巴基斯坦和新加坡分离株的距离最近；经过比对，4株分离株和13株参考株的E蛋白区域有18个氨基酸位点出现替换，NS1蛋白区域有7个氨基酸位点出现替换，NS5蛋白区域有21个氨基酸位点出现替换。结论 广州市2018年输入型DENV - Ⅲ毒株分属于2个不同的基因型亚群，在进化上距离较远，抗原性差异较大；通过全基因组测序和特征分析，逐步完善周边地区的病毒特征信息，为防控工作提供生物学溯源依据，具有重要意义。