| 江苏省一起胃肠炎暴发疫情中分离的诺如病毒基因特征分析 |
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| 引用本文： | 付建光,施超,沙丹,石平,鲍昌俊,艾静. 江苏省一起胃肠炎暴发疫情中分离的诺如病毒基因特征分析[J]. 中华流行病学杂志, 2018, 39(1): 72-74 |
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| 作者姓名： | 付建光 施超 沙丹 石平 鲍昌俊 艾静 |
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| 作者单位： | 210009 南京, 江苏省疾病预防控制中心 卫生部肠道病原微生物重点实验室,214002 无锡市疾病预防控制中心,214002 无锡市疾病预防控制中心,214002 无锡市疾病预防控制中心,210009 南京, 江苏省疾病预防控制中心 卫生部肠道病原微生物重点实验室,210009 南京, 江苏省疾病预防控制中心 卫生部肠道病原微生物重点实验室 |
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| 基金项目： | 重大新发传染病综合防控科技示范工程（BE2015714） |
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| 摘 要： | 目的 分析江苏省一起胃肠炎暴发疫情中分离的诺如病毒基因特征。方法 对2016年12月16－27日江苏省一起急性胃肠炎暴发疫情中病例的肛拭子标本进行核酸提取，利用诺如病毒特异性引物对部分RNA依赖的RNA聚合酶序列及完整衣壳蛋白序列（VP1）进行RT-PCR扩增，扩增产物测序后进行基因特征分析。结果 序列比对结果显示，PCR产物在诺如病毒RNA依赖的RNA聚合酶区与GⅡ.g型别的西班牙株及芬兰株处于同一分支，同源性为98.7%，在VP1区与GⅡ.1型别的美国株同源性更高（99.4%），初步推断为重组病毒。进一步通过重组分析软件Simplot分析，其可能重组位点在VP1的5 106位点，定位在ORF1/2交叠区。VP1氨基酸变异位点分析显示，其假定的抗原表位及受体结合表位均未出现变异，仅在132位氨基酸位点由N突变为S。结论 江苏省胃肠炎暴发疫情中分离的诺如病毒为GⅡ.g-GⅡ.1重组变异株。
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| 关 键 词： | 诺如病毒 重组 基因型别 暴发 |
| 收稿时间： | 2017-06-21 |
Genetic characterization of norovirus isolated in an outbreak of gastroenteritis in Jiangsu province |
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| Fu Jianguang,Shi Chao,Sha Dan,Shi Ping,Bao Changjun and Ai Jing. Genetic characterization of norovirus isolated in an outbreak of gastroenteritis in Jiangsu province[J]. Chinese Journal of Epidemiology, 2018, 39(1): 72-74 |
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| Authors: | Fu Jianguang Shi Chao Sha Dan Shi Ping Bao Changjun Ai Jing |
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| Affiliation: | Key Laboratory of Enteric Pathogenic Microbiology, Ministry of Health, Jiangsu Provincial Center of Disease Control and Prevention, Nanjing 210009, China,Wuxi Prefecture Center for Disease Control and Prevention, Wuxi 214002, China,Wuxi Prefecture Center for Disease Control and Prevention, Wuxi 214002, China,Wuxi Prefecture Center for Disease Control and Prevention, Wuxi 214002, China,Key Laboratory of Enteric Pathogenic Microbiology, Ministry of Health, Jiangsu Provincial Center of Disease Control and Prevention, Nanjing 210009, China and Key Laboratory of Enteric Pathogenic Microbiology, Ministry of Health, Jiangsu Provincial Center of Disease Control and Prevention, Nanjing 210009, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Norovirus Recombinant Genotype Outbreak |
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