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双重荧光实时RT-PCR技术鉴定H9N2亚型禽流感病毒
引用本文:李燕,单军,韩晓冬. 双重荧光实时RT-PCR技术鉴定H9N2亚型禽流感病毒[J]. 中国药科大学学报, 2014, 45(4): 486-490
作者姓名:李燕  单军  韩晓冬
作者单位:南京大学医学院;江苏省疾病预防控制中心;江苏省疾病预防控制中心;南京大学医学院
基金项目:国家自然科学基金资助项目(No.81301448,No.81301448,No.3120040);江苏省疾病预防控制中心重点人才资助项目(No.JKRC20110029)
摘    要:采用双重荧光实时RT-PCR技术,建立一种简便易行的H9N2亚型禽流感病毒的快速鉴定方法。通过比对GenBank甲型禽流感病毒H9N2亚型的HA和NA基因序列,设计特异性针对HA和NA的引物,分别选用FAM和JOE两种不同荧光标记探针,构建双重实时荧光PCR一步法反应体系,同时检测样本中的HA和NA基因。结果显示:扩增曲线和特异性实验结果显示,该体系具有很好的扩增效率,且仅特异性识别H9N2亚型AIV的HA、NA基因,与相关病毒或其他亚型无交叉反应。采用重组质粒pMD19-T构建HA、NA阳性质粒,10倍梯度稀释液为模板,进行荧光定量PCR。结果证实,本研究所建立的双重荧光定量RT-PCR体系敏感性能达到10个RNA拷贝数。采用本方法检测60份感染动物样品及60份环境样品,与传统PCR方法相比,检测敏感性提高了100倍;与病毒分离鉴定方法比较,二者的鉴定结果完全吻合。该方法具有特异性强、灵敏度高、快速易操作等优点,是H9N2亚型禽流感病毒鉴定的有效方法。

关 键 词:禽流感病毒;H9N2;双重荧光实时RT-PCR技术

Detection of avian influenza A subtype H9N2 by duplex real-time reverse transcription polymerase chain reaction
LI Yan,SHAN Jun and HAN Xiaodong. Detection of avian influenza A subtype H9N2 by duplex real-time reverse transcription polymerase chain reaction[J]. Journal of China Pharmaceutical University, 2014, 45(4): 486-490
Authors:LI Yan  SHAN Jun  HAN Xiaodong
Abstract:
Keywords:avian influenza virus   H9N2   duplex rRT-PCR
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