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分枝杆菌临床分离株菌种的分子鉴定
引用本文:邵永珍,范长龙,王娟,纪滨英,全保燕,李迪,江洋深,凌虹. 分枝杆菌临床分离株菌种的分子鉴定[J]. 中国地方病学杂志, 2012, 31(2)
作者姓名:邵永珍  范长龙  王娟  纪滨英  全保燕  李迪  江洋深  凌虹
作者单位:1. 大连大学附属新华医院检验科
2. 哈尔滨市胸科医院检验科
3. 150081,哈尔滨医科大学微生物学教研室、黑龙江省感染与免疫重点实验室、黑龙江省教育厅病原生物学重点实验室
4. 哈尔滨市胸科医院内科
5. 哈尔滨市胸科医院科教科
6. 大连大学新华医院普外科
基金项目:哈尔滨医科大学研究生创新基金
摘    要:目的 建立对临床分离分枝杆菌菌种快速、精确鉴定的方法学平台,了解分枝杆菌菌种的分布,为结核分枝杆菌(MTB)和非结核分枝杆菌(NTM)病临床精确诊断和有效治疗提供依据.方法 330株分枝杆菌分离株来自于2007年5月至2008年12月在哈尔滨市胸科医院诊断为结核病的住院患者.菌株灭活后提取基因组DNA,采用PCR方法,结合PCR-限制性片段长度多态性(RFLP)和DNA序列测定方法进行菌种精确鉴定.结果 330株临床分离菌株全部精确鉴定,其中328株[占99.4%(328/330)]为结核分枝杆菌复合群(MTBC),2株[占0.6%(2/330)]为NTM.328株MTBC中,MTB 326株、非洲分枝杆菌(M.African)1株、田鼠分枝杆菌(M.microti)1株,分别占MTBC的99.4% (326/328)、0.3%(1/328)和0.3%(1/328).经测序和基因组同源性分析发现,2株NTM为胞内分枝杆菌(MAC),与MAC的同源性分别为99%和93%,2株菌之间的同源性为93%.结论 建立了临床分离分枝杆菌菌种快速鉴定的方法学平台,临床诊断为结核病的患者MTB比例占绝对优势,也发现有M.African、M.microti和NTM感染.

关 键 词:分枝杆菌属  菌种鉴定  聚合酶链反应  序列比对

Molecular identification of Mycobacterium clinically isolated strains of bacteria
SHAO Yong-zhen , FAN Chang-long , WANG Juan , JI Bin-ying , QUAN Bao-yan , LI Di , JIANG Yang-shen , LING Hong. Molecular identification of Mycobacterium clinically isolated strains of bacteria[J]. Chinese Jouranl of Endemiology, 2012, 31(2)
Authors:SHAO Yong-zhen    FAN Chang-long    WANG Juan    JI Bin-ying    QUAN Bao-yan    LI Di    JIANG Yang-shen    LING Hong
Abstract:
Keywords:Mycobacterium  Species identification  Polymerase chain reaction  Sequence alignment
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