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基于综合生物信息学的宫颈癌预后模型建立
作者姓名:金伟  王海松  佘冰洋  杨浩斌  张志强  罗琳  谢展鹏  张眉
作者单位:1. 石河子大学医学院;2. 西安交通大学医学部公共卫生学院
基金项目:国家级大学生创新创业训练计划(202210759019);
摘    要:目的:寻找与宫颈癌预后相关的免疫相关性长链非编码RNA(long non-conding RNA,IncRNA),构建宫颈癌预后评估模型,提高宫颈癌的生存率。方法:利用R4.2.1,采用Cox回归分析和最小绝对收缩和选择算子(lasso)Cox回归,寻找癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中宫颈癌患者基因表达差异的长链非编码RNA(lncRNA)及生存信息差异,构建预后模型。利用R软件中“survminer”包(4.2.1版)生成Kaplan-Meier生存曲线,利用R软件中“rms”包(4.2.1版)生成列线图验证模型。结果:采用Cox回归分析和最小绝对收缩和选择算子(lasso)Cox回归模型构建免疫相关的22个lncRNA模型(包括SCP2D1.AS1、LINC00469、LINC00308、LINC00158、MIRLET7BHG、ARRDC1.AS1、SNHG32、DDC.AS1、NUP50.DT、LINC00658、LINC00629、LINC02802、LINC01281、SBF2.AS1、WWC2.AS2、USP30.AS1、...

关 键 词:宫颈癌  总生存率  长链非编码RNA(lncRNA)  预后模型
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