| 基于GEO数据库的银屑病lncRNA筛选与ceRNA网络构建 |
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| 引用本文： | 范晓美,栗铭钊,牛牧田,高进涛.基于GEO数据库的银屑病lncRNA筛选与ceRNA网络构建[J].华夏医学,2023(2):85-92. |
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| 作者姓名： | 范晓美 栗铭钊 牛牧田 高进涛 |
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| 作者单位： | 1. 桂林医学院智能医学与生物技术学院;2. 桂林医学院生物化学与分子生物学重点实验室 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(31860314)；;广西自然科学基金项目(2018GXNSFAA28104,2016GXNSFBA380146)； |
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| 摘 要： | 目的：构建银屑病竞争性内源性RNA(ceRNA)调控网络，为银屑病发病机制提供生物信息学参考。方法：基于基因表达综合数据库(GEO)筛选差异表达的lncRNA并通过相关性分析找到与其相关的编码基因，进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。使用lncBase数据库预测lncRNA的靶向微小RNA(microRNA, miRNA);使用TargetScan数据库预测编码基因靶向miRNA;利用Cytoscape构建ceRNA网络。结果：本研究基于差异表达的lncRNA构建出6个lncRNA(LIN01094、LINC01215、KLF-AS1、TINCR、EMX2OS、C14orf132)介导的lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA网络，显示这些lncRNA可能通过影响细胞周期、蛋白酶体、DNA复制、细胞因子-细胞因子受体的相互作用、FoxO信号通路等发挥作用。结论：差异表达的(lncRNA LIN01094、LINC01215、KLF-AS1、TINCR、EMX2OS、C14orf132)可能作为ceRNA发挥调控功能，参与银屑病发病。
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| 关 键 词： | 银屑病 长链非编码RNA 竞争性内源RNA网络 |
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