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贵阳市2013—2015年手足口病患儿EV71病毒VP1、VP4基因特征分析
引用本文:张正君, 杨兴林, 黄海. 贵阳市2013—2015年手足口病患儿EV71病毒VP1、VP4基因特征分析[J]. 中国公共卫生, 2016, 32(6): 828-831. DOI: 10.11847/zgggws2016-32-06-28
作者姓名:张正君  杨兴林  黄海
作者单位:1.贵州医科大学检验学院, 贵州 贵阳 550004;2.贵阳市公共卫生救治中心
摘    要:目的 分析贵州省贵阳市2013—2015年手足口病患儿肠道病毒 71 型(EV71)VP1和VP4基因特征,为手足口病疫苗的选用和临床诊治提供参考依据。方法 采集2013年8月—2015年4月在贵阳市第五人民医院就诊的120例手足口病轻症患儿鼻咽拭子和(或)粪便标本进行EV71病毒 VP1和VP4 全序列的逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增和测序,并与美国国立生物技术信息中心公布的 EV71 A、B、C基因型代表株进行系统进化分析,根据进化分析结果对此2个片段随机抽取20例与其他地区相同基因型进行氨基酸位点变异分析。结果 所有样本病毒株均为C4基因亚型,与2008年北京、上海、安徽以及2011年深圳分离株成簇,20例EV71病毒株在VP1和VP4氨基酸位点变异与以上城市流行毒株相比,其中12例样本EV7的VP1片段氨基酸序列293位丙氨酸(A)变异为丝氨酸(S),其余位点均只有1例样本发生A26T、N31D、N282S突变,而VP4片段只有1个样本发生K52R突变。结论 贵阳市2013—2015年手足口病患儿的EV71流行株均属C基因型的C4亚型,VP1片段常见A293S、A26T、N31D 和N282S突变,VP4片段偶有K52R突变。

关 键 词:手足口病  肠道病毒71型(EV71)  VP1  VP4  基因特征
收稿时间:2016-02-17

Sequence analysis of VPl and VP4 genes of enterovirus 71 strains isolated from children with hand-foot-mouth disease in Guiyang city,2013-2015
ZHANG Zheng-jun, YANG Xing-lin, HUANG Hai. Sequence analysis of VPl and VP4 genes of enterovirus 71 strains isolated from children with hand-foot-mouth disease in Guiyang city,2013-2015[J]. Chinese Journal of Public Health, 2016, 32(6): 828-831. DOI: 10.11847/zgggws2016-32-06-28
Authors:ZHANG Zheng-jun  YANG Xing-lin  HUANG Hai
Affiliation:1.College of Laboratory Medicine, Guizhou Medical University, Guiyang, Guizhou Province 550004, China
Abstract:
Keywords:hand-foot-mouth disease  enterovirus 71  VP1  VP4  gene characteristics
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