| 白木香倍半萜合成酶As-SesTPS1基因的克隆、生物信息学和表达分析 |
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| 引用本文： | 何欣,叶伟,高晓霞,王磊,章卫民.白木香倍半萜合成酶As-SesTPS1基因的克隆、生物信息学和表达分析[J].中草药,2015,46(5):733-739. |
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| 作者姓名： | 何欣 叶伟 高晓霞 王磊 章卫民 |
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| 作者单位： | 广东药学院药科学院, 广东 广州 510006;广东省微生物研究所 省部共建华南应用微生物国家重点实验室 广东省菌种保藏与应用重点实验室 广东省微生物应用新技术公共实验室, 广东 广州 510070;广东省微生物研究所 省部共建华南应用微生物国家重点实验室 广东省菌种保藏与应用重点实验室 广东省微生物应用新技术公共实验室, 广东 广州 510070;广东药学院药科学院, 广东 广州 510006;广东省微生物研究所 省部共建华南应用微生物国家重点实验室 广东省菌种保藏与应用重点实验室 广东省微生物应用新技术公共实验室, 广东 广州 510070;内蒙古医科大学基础医学院, 内蒙古 呼和浩特 010110;广东省微生物研究所 省部共建华南应用微生物国家重点实验室 广东省菌种保藏与应用重点实验室 广东省微生物应用新技术公共实验室, 广东 广州 510070 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(31100496,81102418);"973"前期专项(2014CB460613);广东省科技计划项目(2012A030100014);广东省中国科学院全面战略合作项目(2011B090300078);广东省科学院野外科学实验站基金项目(Sytz201204) |
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| 摘 要： | 目的基于前期对白木香Aquilaria sinensis转录组测序结果,从白木香总RNA中克隆白木香倍半萜合成酶基因(As-Ses TPS1),并对其进行生物信息学及表达分析。方法利用逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)从白木香总RNA中获得倍半萜合成酶基因As-Ses TPS1的c DNA全长序列;利用生物信息学手段对该序列进行相似性和同源性分析,并预测其编码蛋白的结构和功能;利用q RT-PCR技术检测该基因在白木香不同样品中的表达水平。结果得到倍半萜合成酶基因As-Ses TPS1,开放阅读框(ORF)全长1 671 bp,编码556个氨基酸,其与多条倍半萜合成酶基因具有较高相似性,并含有RRx8W和DDxx D的保守序列;该基因在白木香的沉香样品中高表达。结论 As-Ses TPS1的克隆及其生物信息学和在白木香不同部位表达差异性分析,为白木香倍半萜生物合成代谢途径的研究奠定基础。
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| 关 键 词： | 白木香 倍半萜合成酶 克隆 表达 生物信息学 |
| 收稿时间： | 2014/10/26 0:00:00 |
Cloning, bioinformatics, and expression analysis of sesquiterpene synthase gene As-SesTPS1 from Aquilaria sinensis |
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| HE Xin,YE Wei,GAO Xiao-xi,WANG Lei and ZHANG Wei-min.Cloning, bioinformatics, and expression analysis of sesquiterpene synthase gene As-SesTPS1 from Aquilaria sinensis[J].Chinese Traditional and Herbal Drugs,2015,46(5):733-739. |
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| Authors: | HE Xin YE Wei GAO Xiao-xi WANG Lei and ZHANG Wei-min |
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| Institution: | Department of Pharmacy, Guangdong Pharmaceutical College, Guangzhou 510006, China;State Key Laboratory of Applied Microbiology Southern China, Guangdong Open Laboratory of Applied Microbiology, Guangdong Provincial Key Laboratory of Microbial Culture Collection and Application, Guangdong Institute of Microbiology, Guangzhou 510070, China;State Key Laboratory of Applied Microbiology Southern China, Guangdong Open Laboratory of Applied Microbiology, Guangdong Provincial Key Laboratory of Microbial Culture Collection and Application, Guangdong Institute of Microbiology, Guangzhou 510070, China;Department of Pharmacy, Guangdong Pharmaceutical College, Guangzhou 510006, China;State Key Laboratory of Applied Microbiology Southern China, Guangdong Open Laboratory of Applied Microbiology, Guangdong Provincial Key Laboratory of Microbial Culture Collection and Application, Guangdong Institute of Microbiology, Guangzhou 510070, China;College of Basic Medicine, Inner Mongolia Medical University, Hohhot 010110, China;State Key Laboratory of Applied Microbiology Southern China, Guangdong Open Laboratory of Applied Microbiology, Guangdong Provincial Key Laboratory of Microbial Culture Collection and Application, Guangdong Institute of Microbiology, Guangzhou 510070, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Aquilaria sinensis (Lour ) Gilg sesquiterpene synthase clone expression bioinformatics |
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