| 基于诊断结果相关性分析的肿瘤基因标志物提取方法 |
| |
| 引用本文： | 韩斌,陈岩,来海锋,厉力华,祝磊,代琦.基于诊断结果相关性分析的肿瘤基因标志物提取方法[J].航天医学与医学工程,2010,23(6). |
| |
| 作者姓名： | 韩斌 陈岩 来海锋 厉力华 祝磊 代琦 |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金，国家杰出青年基金，浙江省自然科学基金，浙江省研究生创新项目，浙江省大学生创新项目 |
| |
| 摘 要： | 目的基于微阵列数据,提出提取肿瘤诊断结果相关的基因标志物。方法混合滤波和缠绕方法,采用奇异值分解,以基因和肿瘤诊断结果的相关强度为主要标准,辨识基因标志物,利用基于信息增益的随机森林法对分类率做辅助修正。本方法在3个公共数据库上和常用分类器上做了测试。结果 MonteCarlo统计实验表明,对于Colon数据集,本文方法在NN,RF分类器上显著优于t-test方法;在Prostate数据集上,本文方法在NB的分类器上显著优于对手,在其他数据集和分类器上本方法优于对手但不显著;而在基因稳定度指标上,本方法普遍优于对手。结论提出1种可以定量的,基于可视化的分析基因和诊断结果相关性的方法,与经典方法相比,本文方法提取的基因不仅具有较强的分类性能和对不同分类算法的适应性,而且在总体上也具有较好的基因稳定度。
|
| 关 键 词： | 肿瘤分类 基因选择 微阵列 相关性分析 奇异值分解 |
A Cancer Diagnostic Outcome Relevance Based Gene Marker Identification Method |
| |
| HAN Bin,CHEN Yan,LAI Hai-feng,LI Li-hua,ZHU Lei,DAI Qi.A Cancer Diagnostic Outcome Relevance Based Gene Marker Identification Method[J].Space Medicine & Medical Engineering,2010,23(6). |
| |
| Authors: | HAN Bin CHEN Yan LAI Hai-feng LI Li-hua ZHU Lei DAI Qi |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | |
| 本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录！ |
|
