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中国北方汉族人群VANGL1、FZD3和FZD6基因交互作用与神经管缺陷的关系
作者姓名:石鸥燕  蔡春泉  黎小沛  孙伟  沈永明
作者单位:天津医科大学基础医学院;天津市儿童医院外科;天津市儿童医院检验科
基金项目:国家重点基础研究发展计划(973计划)(2013CB945404);天津市卫生行业重点攻关项目(12KG116);天津市卫生局科技基金(2011KZ87)
摘    要:目的探讨VANGL1、FZD3和FZD6基因单核苷酸多态性(SNPs)位点间的交互作用对中国北方汉族人群神经管缺陷(NTDs)患病风险的影响。方法选取VANGL1基因2个SNPs(rs4 839 469和rs34 059 106),FZD3基因2个SNPs(rs2 241 802和rs28 639 533)以及FZD6基因3个SNPs(rs827 528、rs3 808 553和rs12 549 394),采用PCR扩增和测序的方法对135例NTDs患者和135例正常对照者进行基因分型,使用多因子降维法软件(MDR)分析基因-基因交互作用。结果 VANGL1基因rs4 839 469位点基因型分布在病例组与对照组之间有差异(P0.05),FZD6基因rs3 808 553位点基因型分布在病例组与对照组之间有差异(P0.05);MDR分析结果显示VANGL1、FZD3和FZD6基因交互作用存在于两位点模型(rs4 839 469-rs3 808 553)(OR=3.18,95%CI:1.85~5.44;χ2=18.39,P0.0001),3位点模型(rs4 839 469-rs2 241 802-rs3 808 553)(OR=4.17,95%CI:2.43~7.14;χ2=28.5,P0.0001)以及4位点模型(rs4 839 469-rs2 241 802-rs827 528-rs3 808 553)(OR=7.34,95%CI:3.98~13.54;χ2=45.3,P0.0001)。结论 VANGL1、FZD3和FZD6基因存在交互作用,并可能增加NTDs的发病风险。

关 键 词:VANGL1  FZD3  FZD6  基因-基因交互作用  神经管缺陷
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