去氢骆驼蓬碱对细粒棘球蚴中EgTP53蛋白生物信息学表达的影响 |
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作者姓名: | 林玉霞 巩月红 朱莉娜 赵美玲 潘美驰 赵一聪 王建华 |
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作者单位: | 1. 新疆医科大学药学院;2. 新疆医科大学第一附属医院药学部;3. 省部共建中亚高发病成因与防治国家重点实验室 |
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摘 要: | 目的 基于生物信息学表达分析去氢骆驼蓬碱对细粒棘球蚴中EgTP53蛋白(Echinococcus granulosus of Tumor protein p53, EgTP53)的影响。方法 将EgTP53蛋白与去氢骆驼蓬碱进行分子对接,从美国国家生物技术信息中心数据库(National Center for Biotechnology Information, NCBI)下载EgTP53的氨基酸序列,使用ProtParam蛋白分析工具进行EgTP53蛋白理化性质的预测,通过生信工具ProtScale进行疏水性的预测。使用SignalP5.0在线软件对信号肽进行预测,使用生物学在线软件工具TMHMM分析跨膜区域。借助NetPhos3.1在线软件预测磷酸化位点,利用SOMPA在线软件进行二级结构的预测。使用SWISS-MODEL在线软件对EgTP53的三级结构进行预测,采用IEDB在线软件进行B细胞抗原表位预测。使用MEGA6.0软件构建系统进化树并进行分析;采用实时荧光定量PCR技术检测去氢骆驼蓬碱作用后EgTP53蛋白的mRNA表达水平。结果 分子对接结果显示,EgTP53与去氢骆驼...
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关 键 词: | 细粒棘球蚴 EgTP53蛋白 生物信息学 分子对接 去氢骆驼蓬碱 |
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