对比分析5'-UTR和NS5b区序列确定广东地区HCV基因亚型

［摘要］ 目的 对比丙型肝炎病毒（HCV）不同区段系统进化分析法基因分型的差异，探讨广东地区丙型肝炎患者的HCV基因亚型分布。方法 RT-PCR分别扩增HCV5'-UTR（71nt-311nt）共241bp和NS5b区（8249nt-8650nt）共402bp的片段。序列分析后进行系统进化分析以确定病毒基因型及亚型。结果 HCV NS5b区段分型74例，其中1b亚型51例，2a亚型10例，6a亚型8例，3a亚型2例，3b亚型2例，1a亚型1例；5'UTR区分型74例，其中1型45例，2型11例，6a亚型10例，3a亚型3例，3b亚型5例；两区段共同分型49例，47例基因型一致，2例不同。结论 对比分析HCV不同区段基因序列，可深化对HCV基因型和亚型的了解。初步表明广东地区慢性丙型肝炎患者HCV基因亚型分布以1b为主；其次为2a、6a，两者比例相当；3b、3a也占有一定比例。 ［关键词］丙型肝炎病毒；基因型；5'-非编码区；NS5b区；系统进化分析