儿童肥胖症相关基因的生物信息学分析 |
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引用本文: | 乔召华.儿童肥胖症相关基因的生物信息学分析[J].西部医学,2017,29(5):604-608. |
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作者姓名: | 乔召华 |
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作者单位: | 河南科技大学临床医学院·河南科技大学第一附属医院儿科 |
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基金项目: | 洛阳市优秀科技杰出人才项目(2013150) |
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摘 要: | 【摘要】 目的 筛选儿童肥胖症相关基因,探索儿童肥胖症的发病机制。方法 从基因表达公共数据库(GEO)下载儿童肥胖症基因表达谱数据集GSE9624,采用BRB Array Tools软件包筛选差异表达基因(DEGs),并对差异基因进行GO功能分析、KEGG通路富集分析和pathway相互作用网络分析。结果 共筛选出564个DEGs,其中上调基因333个,下调基因231个。GO富集分析发现DEGs主要参与代谢、细胞因子反应、信号转导、血液凝固等生物学过程,发挥的分子功能包括蛋白结合、蛋白二聚化、离子结合、RNA结合和ATP结合等。KEGG通路分析发现DEGs显著富集的pathway有代谢通路、MAPK信号通路、吞噬体、内质网蛋白加工、T细胞受体通路等。结论 儿童肥胖症患者代谢通路和信号转导通路的相关基因表达水平发生了改变,为进一步阐明儿童肥胖症的分子机制和靶向治疗提供了基础。
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关 键 词: | 儿童肥胖症 差异表达基因 生物信息学 代谢通路 |
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