| 盾叶薯蓣WRKY转录因子的鉴定和生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 王丽娜,王丰青,智惊宇,张苗,张重义,谢彩侠. 盾叶薯蓣WRKY转录因子的鉴定和生物信息学分析[J]. 中草药, 2016, 47(22): 4062-4071 |
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| 作者姓名： | 王丽娜 王丰青 智惊宇 张苗 张重义 谢彩侠 |
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| 作者单位： | 河南中医药大学药学院, 河南 郑州 450046;河南农业大学农学院, 河南 郑州 450002;河南农业大学农学院, 河南 郑州 450002;河南中医药大学药学院, 河南 郑州 450046;福建农林大学中药材GAP研究所, 福建 福州 350002;河南中医药大学药学院, 河南 郑州 450046 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目（81473299） |
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| 摘 要： | 目的鉴定盾叶薯蓣WRKY(DzWRKY)转录因子家族基因,分析DzWRKY蛋白的序列特征,检测DzWRKY在根和叶中的表达量。方法以拟南芥WRKY基因的c DNA为查询序列,应用BLASTn进行比对,应用生物信息学方法进行全长开放阅读框(ORF)预测和蛋白序列特征分析,根据转录组数据检测DzWRKY的表达量。结果共检测到27个具有全长ORF的DzWRKY家族基因,其中6个基因编码的蛋白具有2个WRKY结构域。DzWRKY蛋白均为亲水性蛋白,亚细胞预测为核蛋白,WRKY结构域序列保守程度高。进化分析均把27个DzWRKY蛋白和19个At WRKY蛋白分为3个大类群。27个DzWRKY在叶片中的表达量均比根茎低,高表达的DzWRKY基因主要集中在第I类和第IId亚类。盾叶薯蓣WRKY与已知功能的WRKY序列相似性较低。结论首次从盾叶薯蓣中鉴定出DzWRKY基因,为进一步阐明DzWRKY在盾叶薯蓣生长发育和药效成分代谢中的作用奠定基础。
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| 关 键 词： | 盾叶薯蓣 WRKY 生物信息学 转录因子 蛋白序列特征分析 |
| 收稿时间： | 2016-04-19 |
Identification and bioinformatic analysis on rhizomes of Dioscorea zingiberensis WRKY transcription factor |
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| WANG Li-n,WANG Feng-qing,ZHI Jing-yu,ZHANG Miao,ZHANG Zhong-yi and XIE Cai-xia. Identification and bioinformatic analysis on rhizomes of Dioscorea zingiberensis WRKY transcription factor[J]. Chinese Traditional and Herbal Drugs, 2016, 47(22): 4062-4071 |
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| Authors: | WANG Li-n WANG Feng-qing ZHI Jing-yu ZHANG Miao ZHANG Zhong-yi XIE Cai-xia |
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| Affiliation: | School of Pharmacy, Henan University of Traditional Chinese Medicine, Zhengzhou 450046, China;College of Agronomy, Henan Agricultural University, Zhengzhou 450002, China;College of Agronomy, Henan Agricultural University, Zhengzhou 450002, China;School of Pharmacy, Henan University of Traditional Chinese Medicine, Zhengzhou 450046, China;Institute of Chinese Crude Drugs GAP, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou 350002, China;School of Pharmacy, Henan University of Traditional Chinese Medicine, Zhengzhou 450046, China |
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