芪白平肺胶囊调控慢性阻塞性肺疾病(COPD)相关免疫细胞群分子机制的生物信息学分析 |
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作者姓名: | 王小乐 高雅婷 朱洁 张星星 吴凡 杨勤军 吴迪 童佳兵 李泽庚 |
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作者单位: | 1. 安徽中医药大学研究生院;2. 安徽中医药大学第一附属医院呼吸内科;3. 安徽省中医药科学院中医呼吸病防治研究所;4. 安徽省教育厅重点实验室中医药防治肺系重大疾病重点实验室;5. 安徽中医药大学中医学院 |
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基金项目: | 国家自然科学基金区域创新发展联合基金重点支持项目(U20A20398);国家自然科学基金(81974569);;中国博士后基金(No.2018M640345);;安徽省科技重大专项(201903a07020015);;安徽省自然科学基金(1908085QH,1908085QH340); |
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摘 要: | 目的 通过分析慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者肺组织单细胞转录组测序(scRNA-seq)数据,并联合芪白平肺胶囊网络药理学,探讨芪白平肺胶囊调控COPD相关免疫细胞群及其可能的机制。方法 下载基因表达数据集(GEO)中COPD患者肺组织scRNA-seq数据用于挖掘COPD免疫细胞群及其差异表达RNA;并基于中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)获取芪白平肺胶囊的主要活性成分及其靶基因。通过COPD免疫细胞群的差异表达RNA与芪白平肺胶囊的靶基因映射,构建芪白平肺胶囊的“活性成分-免疫细胞群-靶基因”网络,并经基因本体论(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)、蛋白质相互作用(PPI)分析靶基因的分子作用机制。结果 芪白平肺胶囊中槲皮素(quercetin)、山奈酚(kaempferol)、刺芒柄花素(formononetin)等主要的12个活性成分靶向COPD巨噬细胞、肺泡巨噬细胞、 T细胞等多个免疫细胞群及过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARG)、应激活化蛋白激酶(JUN)、血红素加氧酶1(HMOX1)、低氧诱导因子1α(HIF1A)等基因,且这些基因主要富集于白细胞...
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关 键 词: | 芪白平肺胶囊 慢性阻塞性肺疾病(COPD) 单细胞转录组测序 免疫细胞 中医 |
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