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在我国传播的HIV-1 CRF65_CPX亚型毒株pol基因序列特征
引用本文:赵帅,冯毅,洪坤学,卢红艳,辛若雷,廖玲洁,阮玉华,胡婧,郝明强,邵一鸣,邢辉.在我国传播的HIV-1 CRF65_CPX亚型毒株pol基因序列特征[J].中国艾滋病性病,2018(6).
作者姓名:赵帅  冯毅  洪坤学  卢红艳  辛若雷  廖玲洁  阮玉华  胡婧  郝明强  邵一鸣  邢辉
作者单位:中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防控制中心;北京市疾病预防控制中心
摘    要:目的探索亚型为CRF65_CPX艾滋病病毒(HIV)毒株在中国不同高危人群间的传播特征,基因序列及其CTL表位的变化。方法收集2017年6月之前中国鉴定HIV-1亚型为CRF65_CPX的毒株的pol基因区序列,使用比对好的pol基因区序列进行贝叶斯分析。以系统进化树为根据,选择其中同性性传播人群和异性性传播人群序列,分别生成共享序列后,比较两个人群氨基酸位点和HLA-B位点等位基因限制的CTL表位的差异。结果共收集获得CRF65_CPX HIVpol基因区序列52条。贝叶斯分析结果显示,异性性传播人群的最近共同祖先的时间为1999年,同性性传播人群的最近共同祖先的时间为2003年,CRF65_CPX毒株出现在异性性传播人群的时间早于同性性传播人群。与异性性传播人群相比,同性性传播人群pol区共享序列有10个氨基酸位点发生变化;丢失了两个有数据证明的保护性CTL表位(B*2702、B*5103)。结论 CRF65_CPX毒株为中国近些年才发现的多重重组的新型毒株,其在中国的传播途径从异性性传播转变为以同性性传播为主,氨基酸位点和CTL表位在传播过程中也产生了变化,这种变化可能加速了疾病进程,故应引起并加强对该亚型及其类似的新型病毒株不断扩散传播的重视。

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