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柴胡药材干根DNA提取及RAPD分析
引用本文:南晓洁,郝媛媛,赵艮贵,韩榕,秦雪梅. 柴胡药材干根DNA提取及RAPD分析[J]. 中草药, 2009, 40(3): 447-451
作者姓名:南晓洁  郝媛媛  赵艮贵  韩榕  秦雪梅
作者单位:1. 山西师范大学生命科学学院,山西,临汾,041004
2. 山西大学,化学生物学与分子工程教育部重点实验室,山西,太原,030006
摘    要:目的 探索一种适用于柴胡药材干根DNA提取的方法,为实现以分子标记方法辨别柴胡药材奠定基础.方法 比较研究了分别用CTAB法、SDS法和高盐低pH法等3种方法提取柴胡样品基因组DNA.柴胡药材干根经过PVP以及TNE缓冲液进行不同的预处理,以CTAB法抽提DNA.以EcoR I/Mse I双酶切琼脂糖凝胶电泳及RAPD扩增检测提取DNA的质量.采用NTSYS-pc软件计算Jaccard遗传相似系数,以非加权配对算术平均数法(UPGMA)建立聚类图.结果 常规DNA提取方法提取药材干根DNA溶液经4℃放置后,黏稠并褐变,严重影响酶切和RAPD扩增.样品预处理优化条件是研磨时加入3%PVP,TNE缓冲液于0℃浸提2次,每次30min.以该优化的预处理方法处理6个柴胡药材干根样品,提取DNA条带清晰,酶切完全,RAPD扩增图谱清晰稳定,共获得有效扩增条带28条,其中多态性条带为20条,占71.43%.聚类分析表明,6个栽培品中,原产地为山西灵丘外地引种(LQWY)和甘肃陇西(LX)、山西灵丘(LQ)和山西方山(FSH)的亲缘关系较近,陕西商洛(SHL)和其他5个栽培品的亲缘关系较远.结论 柴胡药材干根经过预处理后,可采用常规的DNA提取方法抽提DNA,所提DNA适合于酶切、RAPD等分子标记分析.

关 键 词:柴胡  干根  DNA  RAPD
收稿时间:2008-05-25

Genomic DNA extraction and RAPD analysis from dried roots of Bupleurum chinense
NAN Xiao-jie,HAO Yuan-yuan,ZHAO Gen-gui,HAN Rong and QIN Xue-mei. Genomic DNA extraction and RAPD analysis from dried roots of Bupleurum chinense[J]. Chinese Traditional and Herbal Drugs, 2009, 40(3): 447-451
Authors:NAN Xiao-jie  HAO Yuan-yuan  ZHAO Gen-gui  HAN Rong  QIN Xue-mei
Affiliation:College of Life Science,Shanxi Normal University,Linfen 041004,China;Key Laboratory of Chemical Biology and Molecular Engineering,Ministry of Education,Shanxi University,Taiyuan 030006,China;Key Laboratory of Chemical Biology and Molecular Engineering,Ministry of Education,Shanxi University,Taiyuan 030006,China;College of Life Science,Shanxi Normal University,Linfen 041004,China;Key Laboratory of Chemical Biology and Molecular Engineering,Ministry of Education,Shanxi University,Taiyuan 030006,China
Abstract:
Keywords:B upleurum chinense DC.  dried roots  genomic DNA  RAPD
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