| 湖北地区人类免疫缺陷病毒-1主要流行株外膜蛋白基因V3-V4区序列变异分析 |
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| 引用本文： | 褚小刚,李艳,詹发先,汤恒,陈惠萍,龚作炯. 湖北地区人类免疫缺陷病毒-1主要流行株外膜蛋白基因V3-V4区序列变异分析[J]. 中华传染病杂志, 2008, 26(12) |
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| 作者姓名： | 褚小刚 李艳 詹发先 汤恒 陈惠萍 龚作炯 |
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| 作者单位： | 1. 湖北省疾病预防控制中心,430079
2. 武汉大学人民医院感染科 |
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| 基金项目： | 湖北省卫生厅科研项目 |
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| 摘 要： | 目的 分析湖北地区HIV-1主要流行株外膜蛋白V3-V4区序列特征,了解其流行特点和变异规律.方法 对湖北地区HIV-1主要流行区域进行流行病学调查,应用套式PCR对102例HIv-1感染者的env基因V3-V4区进行扩增,对阳性扩增样本进行基因测序和序列分析.比较基因距离的差异用卡方检验;基因距离的变异性分析使用描述性分析法.结果 湖北地区共发现4种HIV亚型和重组亚型,其中B'亚型占82.69%,B'/C重组毒株、CRF01_AE重组毒株各占7.69%,C亚型占1.92%.湖北地区HIV-1B'亚型与来源于云南和河南等地的HIV-1B'亚型代表株之间的基因距离分别为7.08±2.19和7.88±2.28.其流行时间约为10年;氨基酸序列变异分析显示,HIV-1B'亚型毒株env基因V3、C3、V4区域均发生不同程度变异,其中以V4区的变异程度最大,V3环顶端四肽表现为GPGR、GPGK、GPGQ和GQGR,分别占46.5%、30.2%、13.6%和9.3%;V3环辅助受体预测显示,其中16.28%为CCR5型,13.95%为CXCR4型,69.77%无法预测;糖基化位点分析显示.湖北地区HIV-1主要流行株env V3-V4区9个糖基化位点有8个存在不同程度丢失.结论 B'亚型仍是湖北地区HIV优势流行株,与来源于云南和河南等地的毒株有较高同源性.
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| 关 键 词： | 基因型 基因,病毒 膜蛋白质类 变异(遗传学) |
Sequence variation in the env V3-V4 region of human immunodeficiency virus-1 predominant subtype B strains in Hubei Province |
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| CHU Xiao-gang,LI Yan,ZHAN Fa-xian,TANG Heng,CHEN Hui-ping,GONG Zuo-jiong. Sequence variation in the env V3-V4 region of human immunodeficiency virus-1 predominant subtype B strains in Hubei Province[J]. Chinese Journal of Infectious Diseases, 2008, 26(12) |
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| Authors: | CHU Xiao-gang LI Yan ZHAN Fa-xian TANG Heng CHEN Hui-ping GONG Zuo-jiong |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | HIV-1 Genotype Genes,viral Membrane proteins Variation (Genetics) HIV-1 |
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