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基于lncRNA-miRNA-mRNA网络研究慢性髓系白血病的甲磺酸伊马替尼耐药机制
引用本文:陈冬梅,赵盼,蒙洁,康甲超,韩乐,王晶.基于lncRNA-miRNA-mRNA网络研究慢性髓系白血病的甲磺酸伊马替尼耐药机制[J].甘肃中医学院学报,2022(3):1-11.
作者姓名:陈冬梅  赵盼  蒙洁  康甲超  韩乐  王晶
作者单位:甘肃中医药大学公共卫生学院
基金项目:国家自然科学基金地区项目(82060829);;甘肃省教育厅高等学校科学研究一般项目(甘财教[2013]116号);;甘肃省卫生行业科研计划项目(GSWSKY2017-27);
摘    要:目的 通过对甲磺酸伊马替尼(IM)处理的K562和K562G细胞长链非编码RNA(lncRNA)、微小RNA(miRNA)、信使RNA(mRNA)表达谱进行检测,探究慢性髓系白血病(CML)对IM耐药的分子机制。方法 实验分为K562组、K562G组、K562+IM组、K562G+IM组4组,各组细胞分别培养0,6,12,24 h,采用3-(4,5-二甲基噻唑-2)-2,5-二苯基四氮唑溴盐(MTT)法检测各组细胞增殖情况;基因芯片技术检测培养最适时间时细胞lncRNA、miRNA、mRNA的表达情况,并采用定量反转录PCR(qRT-PCR)法对差异lncRNAs进行验证;通过组间比较,获得耐药特异性基因并对耐药特异性mRNAs进行基因本体(GO)富集分析及生物学通路分析,然后选取耐药特异性基因用于lncRNA-miRNA-mRNA(ceRNA)网络的构建。结果 加入IM培养24 h时,K562细胞增殖抑制率达90%以上;与K562细胞比较,K562G细胞增殖抑制率较低(P<0.01)。qRT-PCR结果显示,11个lncRNAs的表达情况和芯片分析的结果一致(P<0.01...

关 键 词:慢性髓系白血病  甲磺酸伊马替尼  长链非编码RNA  微小RNA  信使RNA  耐药机制
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