| 生物信息学方法筛选乳腺癌关键基因初探 |
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| 引用本文： | 朱非白,朱萧,韦长元,覃庆洪,练斌.生物信息学方法筛选乳腺癌关键基因初探[J].广西医学,2013,35(1):22-24. |
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| 作者姓名： | 朱非白 朱萧 韦长元 覃庆洪 练斌 |
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| 作者单位： | 广西医科大学研究生学院;广西医科大学附属肿瘤医院 |
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| 基金项目： | 广西医疗卫生科研课题(重2010079) |
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| 摘 要： | 目的寻找具有诊断或靶向治疗作用的乳腺癌关键基因。方法通过美国国立生物技术信息中心(NCBI)中已明确的乳腺癌相关数据集,运用生物信息学中的基因组富集分析(GSEA)初步筛选,并富集出相应的通路;在此基础上继续用Meta分析方法筛选出乳腺癌的关键基因。结果根据GSEA和Meta分析出差异基因22个,再与NCBI数据中与乳腺癌相关的基因的结构、功能比较,得出TGFBR2、CDKN1A、GADD45α、CXCL12为关键基因。结论 TGFBR2、CDKN1A、GADD45α、CXCL12等基因与乳腺癌细胞周期、分化和凋亡有密切关系,可进一步研究以期作为乳腺癌诊断和靶向治疗的基因。
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| 关 键 词： | 乳腺癌 生物信息学 基因组富集 Meta分析 关键基因 |
Key Genes in Breast Cancer Based on Bioinformatics Pipeline |
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| ZHU Fei-bai,ZHU Xiao,WEI Chang-yuan,QIN Qing-hong,LIAN Bin.Key Genes in Breast Cancer Based on Bioinformatics Pipeline[J].Guangxi Medical Journal,2013,35(1):22-24. |
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| Authors: | ZHU Fei-bai ZHU Xiao WEI Chang-yuan QIN Qing-hong LIAN Bin |
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| Institution: | 1 Graduate School,2 Affiliated Cancer Hospital,Guangxi Medical University,Nanning 530021,China) |
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| Abstract: | |
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