| 肺鳞癌PD-L1共表达基因及转录调控网络分析 |
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| 引用本文： | 冯飞跃,邱斌,李春晓,钱海利,高树庚. 肺鳞癌PD-L1共表达基因及转录调控网络分析[J]. 解放军医学杂志, 2017, 42(5). DOI: 10.11855/j.issn.0577-7402.2017.05.01 |
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| 作者姓名： | 冯飞跃 邱斌 李春晓 钱海利 高树庚 |
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| 作者单位： | 1. 100021,北京 国家癌症中心/中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院胸外科;2. 100021,北京 国家癌症中心/中国医学科学院北京协和医学院分子肿瘤学国家重点实验室 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划项目(2016YFC0905400)This work was supported by the National Key Research and Development Program |
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| 摘 要： | 目的 绘制肺鳞癌中细胞程序性死亡配体1(PD-L1)共表达基因关系网络,筛选潜在的PD-L1协同检测生物标志物,寻找可能参与PD-L1调控肿瘤免疫状态的基因及通路.方法 采用TCGA肺鳞癌数据集,利用cBioPortal数据分析平台进行共表达基因集检索,从全基因转录组水平对PD-L1的共表达基因进行Venny分析,筛选目标基因,进行多种类型的聚类和分子关系网络分析,并建立PD-L1调控网络.结果 共获得PD-L1中等程度表达相关基因126个,主要为质膜定位型基因,功能集中在免疫调节过程,其中IRF2/NFKB 1/IRF1三个转录因子参与了对PD-L1基因集30％以上基因的转录调控.经过PD-L1共表达基因集的核心分子筛选,分析网络节点连接度,得到具有最高连接度的前6个节点基因,依次为IFNG、JAK2、STAT1、CTLA4、CD80和CCR5,对这些基因不同表达水平的肺癌患者的生存情况进行分析,结果显示CCR5是一个有意义的预后指标分子.进一步对PD-L1和CCR5的表达谱数据进行相关性分析,结果显示CCR5与PD-L1表达谱水平的Pearson相关系数为0.47(P＜0.05);GO-BP聚类分析显示,CCR5的功能主要聚集在免疫调控、T细胞调控、细胞信号转导等领域,与PD-L1调控网络的功能相符.结论 PD-L1共表达基因集内的主要节点均为免疫相关分子,其中IFNG、CCR5、NFKB1分子对PD-L1共表达基因网络具有最广泛的调控作用,该发现为肺鳞癌免疫治疗的研究和应用奠定了一定基础.
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| 关 键 词： | 肺肿癌 癌,鳞状细胞 细胞程序性死亡配体1 免疫调控 |
Co-expression and transcriptional regulation network analysis of PD-L1 in lung squamous cell carcinoma |
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| FENG Fei-yue,QIU Bin,LI Chun-xiao,QIAN Hai-li,GAO Shu-geng. Co-expression and transcriptional regulation network analysis of PD-L1 in lung squamous cell carcinoma[J]. Medical Journal of Chinese People's Liberation Army, 2017, 42(5). DOI: 10.11855/j.issn.0577-7402.2017.05.01 |
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| Authors: | FENG Fei-yue QIU Bin LI Chun-xiao QIAN Hai-li GAO Shu-geng |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | lung neoplasms carcinoma,squamous cell programmed cell death ligand 1 immune regulation |
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