| 自噬相关基因在类风湿关节炎滑膜组织的表达及调控机制 |
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| 引用本文： | 陈雪芹,李灵兰,付国涛,韩莉欣,毋瑞朋,熊咏民,史传道,刘启玲,张荣强. 自噬相关基因在类风湿关节炎滑膜组织的表达及调控机制[J]. 中国医学科学院学报, 2022, 44(6): 950-960. DOI: 10.3881/j.issn.1000-503X.14779 |
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| 作者姓名： | 陈雪芹 李灵兰 付国涛 韩莉欣 毋瑞朋 熊咏民 史传道 刘启玲 张荣强 |
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| 作者单位： | 1.陕西中医药大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室,陕西咸阳 712046;2.陕西省卫生健康委员会疾病控制处,西安 710003;3.西安交通大学公共卫生学院地方病研究所,西安 710061;4.西藏民族大学医学公共卫生与预防医学教研室,陕西咸阳 712082 |
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| 基金项目： | 陕西省重点研发计划项目(2020SF-076);陕西省教育厅重点科学研究计划项目(19JS015);陕西中医药大学慢性非传染性疾病病因及机制研究创新团队(132041933);中国富硒产业研究院富硒产业全产业链专项研发计划项目(2020FXZX05-01) |
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| 摘 要： | 目的 研究自噬相关基因(ATG)在类风湿关节炎(RA)中的表达调控和自噬机制。方法 从GSE55235和GSE55457中鉴定出RA的差异表达基因(DEG),结合人类自噬数据库,筛选出差异表达自噬相关基因(DE-ATG)。利用STRING 11.0和GeneMANIA数据库建立蛋白互作网络。此外,NetworkAnalyst和Cytoscape建立转录因子-基因-miRNA共表达网络。最后,受试者工作特征曲线分析和DrugBank鉴定预测生物标志物的效能和靶向药物的性能。GraphPad prism 8.2.1和R 4.0.3用于统计分析和图形制作。结果 485个DEG在T细胞激活、激素调节、破骨细胞分化、RA和趋化因子等信号通路富集。11个DE-ATG通过hsa-mir-155-5p、RUNX1、TP53和SOX2等调控RA滑膜组织的表达,与四氯二苯二氧芑、二氧化硅有较强的环境因子调控关系。受试者工作特征曲线分析确定了具有良好敏感性和特异性的基因,如MYC、MAPK8、CDKN1A和TNFSF10,可用于区分某些表型,这可能是RA的新型生物标志物。结论 DE-ATG在RA中表达下调可能会促进软骨细胞凋亡和分解,新型生物标志物的确立为诊断和治疗RA提供了新思路和方法,转录因子-基因-miRNA网络的建立为解析滑膜炎症和关节软骨破坏提供直接证据。
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| 关 键 词： | 类风湿关节炎 自噬 转录因子 miRNA |
| 收稿时间： | 2021-12-10 |
Expression and Regulatory Mechanism of Autophagy-related Genes in Synovial Tissues of Patients with Rheumatoid Arthritis |
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| CHEN Xueqin,LI Linglan,FU Guotao,HAN Lixin,WU Ruipeng,XIONG Yongmin,SHI Chuandao,LIU Qiling,ZHANG Rongqiang. Expression and Regulatory Mechanism of Autophagy-related Genes in Synovial Tissues of Patients with Rheumatoid Arthritis[J]. Acta Academiae Medicinae Sinicae, 2022, 44(6): 950-960. DOI: 10.3881/j.issn.1000-503X.14779 |
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| Authors: | CHEN Xueqin LI Linglan FU Guotao HAN Lixin WU Ruipeng XIONG Yongmin SHI Chuandao LIU Qiling ZHANG Rongqiang |
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| Affiliation: | 1.Department of Epidemiology and Health Statistics,School of Public Health,Shaanxi University of Chinese Medicine,Xianyang,Shaanxi 712046,China;2.Disease Control Division,Shaanxi Provincial Health Commission,Xi'an 710003,China;3.Institute of Endemic Diseases,School of Public Health,Xi'an Jiaotong University,Xi'an 710061,China;4.Department of Public Health and Preventive Medicine,Xizang Minzu University,Xianyang,Shaanxi 712082,China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | |
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