基于癌症基因图谱数据库分析Ephrin As在肝癌中的表达及评估肝癌发生的价值

目的 通过对癌症基因图谱（TCGA）数据库中肝癌转录组数据集进行分析，寻找新的预测肝癌发生相关的基因。方法 下载并纳入TCGA数据库中347例肝癌和50例正常癌旁对照的转录组与临床资料数据，进行Ephrin A1～5(EFNA1～5)m RNA表达差异分析。经logistic回归分析建立联合预测指标，并按肝癌StageⅠ～Ⅳ分组，分别与正常组进行比较，采用受试者工作特征（ROC）曲线评估Ephrin As(EFNAs)单项及多项联合在预测肝癌发生以及进展各个分期的价值。结果 肝癌组EFNA1、EFNA3、EFNA4 mRNA表达水平高于正常组，EFNA2、EFNA5 mRNA表达水平低于正常组，差异有统计学意义（P<0.01）。EFNA3、EFNA4 mRNA联合预测肝癌发生的ROC曲线下面积（AUC）为0.923，敏感度为0.879，特异度为0.880;EFNA3、EFNA4 mRNA联合预测肝癌进展StageⅠ、Ⅱ、Ⅲ的ROC曲线下面积分别为0.908、0.946、0.938，均比单项EFNAs mRNA预测效能高。结论 EFNAs可能作为预测肝癌发生的良好指标，且EFNA3...