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蛇毒C型凝集素家族结构及抗原表位预测
引用本文:涂硕,陈柯,钟立鹏,黄春洪.蛇毒C型凝集素家族结构及抗原表位预测[J].中国免疫学杂志,2010,26(11).
作者姓名:涂硕  陈柯  钟立鹏  黄春洪
作者单位:南昌大学基础医学院生物化学教研室,南昌,330006
基金项目:国家自然科学基金资助,江西省科技支持项目 
摘    要:目的:预测和设计蛇毒C型凝集素家族蛋白(CLPs)共同B细胞抗原表位肽。方法:利用expasy蛋白质数据库在线软件Align对CLPs进行序列比对。运用DNAstar和Antheprot软件对蛇毒CLP家族的二级结构和表面特性,如亲水性、表面可及性、免疫原性、柔韧性等,综合各结果预测其抗原表位。采用Swiss-model和SEPPA在线工具进行三维结构和空间表位预测。结果:蛇毒CLP家族存在多个潜在的抗原表位位点,其中46~58区和98~110区肽段为可能的B细胞表位区。结论:综合考虑以上2个肽段家族同源性和表面特征,确定N端附近的46KTWADAEKFCTEQ58为蛇毒CLP可能的共同抗原区。

关 键 词:蛇毒  C型凝集素蛋白  B细胞抗原表位

Structural analysis and antigenic epitope prediction of snake venom C type lectin family proteins
TU Shuo,CHEN Ke,ZHONG Li-Peng,HUANG Chun-Hong.Structural analysis and antigenic epitope prediction of snake venom C type lectin family proteins[J].Chinese Journal of Immunology,2010,26(11).
Authors:TU Shuo  CHEN Ke  ZHONG Li-Peng  HUANG Chun-Hong
Abstract:
Keywords:
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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