吴茱萸属4种药用植物的叶绿体基因组比较与系统发育分析

目的：明确楝叶吴萸、臭辣吴萸、吴茱萸和石虎4种药用植物叶绿体基因组特征与系统发育关系，为吴茱萸药材的分子鉴定提供依据。方法：使用CTAB法提取叶片总基因组DNA，通过Illumina NovaSeq 6000平台测序，再用SPAdes软件组装叶绿体基因组序列，利用condonW、REPuter、mVISTA等软件进行序列特征分析并构建ML系统发育树。结果：4种吴茱萸属植物叶绿体基因组为典型的四分体结构，基因组大小在158 563～158 762 bp之间，总GC含量为38.34%～38.37%。均注释到134个编码基因，包括89个蛋白编码基因（PCGs）,37个tRNA基因和8个rRNA基因。共检测到79～98个简单重复序列（SSR）和35～41个长重复序列。叶绿体基因组比较分析表明4个物种的反向重复区（IR）边界存在差异，单拷贝区（SC）比IR区表现出更高的变异性，筛选出了trnS-trnG、ycf4-cemA和psbM-trnA等10个高多样性片段，这些片段可用于吴茱萸属物种鉴定和系统发育研究。系统发育分析结果表明，吴茱萸与石虎聚为一支，楝叶吴萸和臭辣吴萸聚为一支，且这两支互为姊妹...