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霍乱弧菌JS94484株CTX~(EVC)_φ和nct-CTX~(new)_φ基因组变异区序列分析
作者姓名:芮勇宇  阚飙  高守一  刘延清  祁国明
作者单位:南方医科大学南方医院检验科 广东广州510515(芮勇宇),中国疾病预防控制中心传染病预防控制所 北京102206(阚飙,高守一,刘延清),中国疾病预防控制中心传染病预防控制所 北京102206(祁国明)
基金项目:国家自然科学基金(30470099,30170821)~~
摘    要:目的对霍乱弧菌JS94484株CTXEVCφ和nct-CTXnewφ基因组变异区进行序列分析。方法采用聚合酶链反应、基因测序及序列分析。结果JS94484株CTXEVCφ基因组的ig1、rstR、ig2和ctxAB基因与EVC标准株N16961的高度同源。JS94484株nct-CTXnewφ基因组的ig1、rstR和ig2基因,与目前发现的3种类型的同源性均较低,趋异性均较高。CTXEVCφ和nct-CTXnewφ基因组zot基因末端约60bp的基因序列差别较大,推测的氨基酸序列差别也较大。JS94484株的tcpA基因序列与EVC标准株N16961的完全一致。结论霍乱弧菌nct-CTXnewφ基因组的ig1、rstR和ig2基因为新类型,基因功能有待于进一步研究。

关 键 词:霍乱弧菌  噬菌体  毒力协同调节菌毛A亚单位  聚合酶链反应  序列分析
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