摘 要: | 目的 通过生物信息学分析筛选卵巢早衰(premature ovarian failure, POF)患者的差异表达长链非编码RNA(long non-coding RNA, LncRNAs),研究POF病理机制,预测潜在治疗靶点。方法 选取GEO数据库中与POF相关的基因芯片,利用GEO2R在线分析软件筛选颗粒细胞中差异表达LncRNAs。通过mircode数据库和miRNA靶基因预测网站预测靶基因,采用Cytoscape 3.7.2软件绘制基因交互作用网络模型。在DAVID数据库进行基因本体论(gene ontology, GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)富集分析。结果 共筛选出1 110个差异表达LncRNAs(P<0.01,|log2FC|≥1.0,FC为差异倍数),其中上调基因905个,下调基因205个,其靶基因主要与金属离子跨膜转运蛋白活性、DNA与转录因子结合能力、蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性相关,并且主要富集于PI3K-Akt、MAPK、Rap1、Ra...
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