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| 卵巢早衰患者颗粒细胞关键LncRNAs的生物信息学分析 | |
| 作者姓名： | 熊仪 黄婷婷 麦哲芬 霍少川 韩霞 |
| 作者单位： | 广州中医药大学深圳医院(福田) |
| 摘 要： | 目的 通过生物信息学分析筛选卵巢早衰(premature ovarian failure, POF)患者的差异表达长链非编码RNA(long non-coding RNA, LncRNAs),研究POF病理机制，预测潜在治疗靶点。方法 选取GEO数据库中与POF相关的基因芯片，利用GEO2R在线分析软件筛选颗粒细胞中差异表达LncRNAs。通过mircode数据库和miRNA靶基因预测网站预测靶基因，采用Cytoscape 3.7.2软件绘制基因交互作用网络模型。在DAVID数据库进行基因本体论(gene ontology, GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)富集分析。结果 共筛选出1 110个差异表达LncRNAs(P<0.01,|log2FC|≥1.0,FC为差异倍数),其中上调基因905个，下调基因205个，其靶基因主要与金属离子跨膜转运蛋白活性、DNA与转录因子结合能力、蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性相关，并且主要富集于PI3K-Akt、MAPK、Rap1、Ra... |
| 关 键 词： | 卵巢早衰 颗粒细胞 生物信息学分析 差异表达基因 靶基因 |