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| 寡核苷酸芯片在细胞因子及其受体单核苷酸多态性检测中的应用 | |
| 引用本文： | Guo YF,Tan JM,Li RY,Liu SZ,Li Y,Ying K,Xie Y,Mao YM. 寡核苷酸芯片在细胞因子及其受体单核苷酸多态性检测中的应用[J]. 中华医学杂志, 2005, 85(25): 1757-1761 |
| 作者姓名： | Guo YF Tan JM Li RY Liu SZ Li Y Ying K Xie Y Mao YM |
| 作者单位： | 1. 200080,上海交通大学附属第一人民医院肾移植科 2. 上海联合基因科技集团博星芯片研究所 3. 上海复旦大学遗传研究所 |
| 基金项目： | 上海市科委重大课题基金资助项目(024919005),全军“十五”医学杰出人才基金资助项目(01J003) |
| 摘 要： | 目的建立检测细胞因子肿瘤坏死因子(TNF)-α、白细胞介素(IL)-10、转化生长因子(TGF)-β1、IL-4、IL-6及其受体单核苷酸多态性位点的寡核苷酸芯片,通过测序等方法评价其性能。方法根据相关文献、参照NCBI的SNP数据库和NCI的SNP 500 Cancer数据库,选取临床上有意义的细胞因子及其相应受体单核苷酸多态性位点基因和相应序列,设计寡核苷酸探针59条,基因组DNA通过多重多聚酶链反应(PCR)扩增,Cy5标记。标记后的产物与芯片上探针杂交,激光扫描,荧光信号值分析,判断各位点的基因型,并通过测序验证。结果130份外周血样,除10份因时间过久,没有PCR产物外,余120份均检测成功,3次重复检验无差异,测序验证无位点错误。结论寡核苷酸芯片技术检测细胞因子及其受体单核苷酸多态性位点,具有特异性高、敏感性高、重复性好、高通量、操作简便等优点,是一种较为理想的方法。 |
| 关 键 词： | 寡核苷酸芯片 细胞因子 单核苷酸多态性 受体 多态性位点 （TNF）-α 肿瘤坏死因子 转化生长因子 Cancer 寡核苷酸探针 多聚酶链反应 基因组DNA 白细胞介素 PCR产物 IL-4 IL-6 方法评价 NCBI 探针杂交 激光扫描 重复检验 |
Application of oligonucleotide array in single nucleotide polymorphism typing of cytokines and cytokine receptors |
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| Guo Yi-feng,Tan Jian-ming,Li Rong-yu,Liu San-zhen,Li Yao,Ying Kang,Xie Yi,Mao Yu-min. Application of oligonucleotide array in single nucleotide polymorphism typing of cytokines and cytokine receptors[J]. Zhonghua yi xue za zhi, 2005, 85(25): 1757-1761 | |
| Authors: | Guo Yi-feng Tan Jian-ming Li Rong-yu Liu San-zhen Li Yao Ying Kang Xie Yi Mao Yu-min |
| Affiliation: | Shanghai First People's Hospital, Shanghai Organ Transplant and Research Center, Shanghai 200080, China. |
| Abstract: | |
| Keywords: | Cytokine Single nucleotide polymorphism (SNP) Oligoneucleotide array |
| 本文献已被 CNKI 维普 万方数据 PubMed 等数据库收录！ | |