| 基于microRNA调控网络预测卵巢癌多药耐药相关基因 |
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| 引用本文： | 陈昌贤,胡艳玲,李力.基于microRNA调控网络预测卵巢癌多药耐药相关基因[J].中国肿瘤生物治疗杂志,2015,22(2):204-208. |
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| 作者姓名： | 陈昌贤 胡艳玲 李力 |
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| 作者单位： | 1. 广西医科大学附属肿瘤医院妇瘤科,广西南宁,530021
2. 广西医科大学医学科学实验中心生物信息学教研室,广西南宁,530021 |
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| 基金项目： | 国家高技术研究发展计划（863计划）资助项目（No. 2012AA02A507）；广西自然科学基金资助项目（桂财教2014-118号）；广西科学研究与技术开发计划课题资助项目（桂科攻14124004-1-24）。 |
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| 摘 要： | 目的:基于microRNA(miRNA)调控网络预测卵巢癌多药耐药相关基因。方法:综合运用文本挖掘、网络构建和预测等生物信息学分析方法,挖掘卵巢癌化疗耐药相关miRNA和miRNA-靶基因数据,并构建miRNA调控网络,利用已知miRNA对卵巢癌多药耐药相关基因进行预测。结果:文本挖掘出11个与卵巢癌化疗耐药相关的miRNA,包括miR-130a、miR-214、let-7i、miR-125b、miR-376c、miR-199a、miR-93、miR-141、miR-130b、miR-193b*和miR-200c。在miRNA靶基因预测数据软件Target Scan中挖掘出47 077个miRNA-靶基因数据,而Pic Tar挖掘出1 675个miRNA-靶基因数据。在miRNA调控网络中,神经素1基因(neuropilins,NRP1)是最重要的Hub-基因。结论:利用已知miRNA构建miRNA调控网络进而预测卵巢癌多药耐药相关基因是一种行之有效的方法。NRP1极有可能在卵巢癌化疗耐药形成中扮演着重要的角色,是卵巢癌潜在的药物治疗靶点。
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| 关 键 词： | 卵巢癌 多药耐药 基因 microRNA调控网络 预测 神经素1基因 |
| 收稿时间： | 2015/1/23 0:00:00 |
| 修稿时间： | 3/7/2015 12:00:00 AM |
MicroRNA regulatory network-based prediction of multidrug resistance genes in ovarian cancer |
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| Chen Changxian,Hu Yanling and Li Li.MicroRNA regulatory network-based prediction of multidrug resistance genes in ovarian cancer[J].Chinese Journal of Cancer Biotherapy,2015,22(2):204-208. |
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| Authors: | Chen Changxian Hu Yanling and Li Li |
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| Institution: | Department of Gynecologic Oncology, Affiliated Tumor Hospital of Guangxi Medical University, Nanning 530021, Guangxi, China;Department of Bioinformatics, Medical Research Center, Guangxi Medical University, Nanning 530021, Guangxi, China;Department of Gynecologic Oncology, Affiliated Tumor Hospital of Guangxi Medical University, Nanning 530021, Guangxi, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | ovarian cancer multidrug resistance gene microRNA regulatory network predict neuropilins 1 (NRP1) |
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