用DNAStar软件预测Rv1410c结核分枝杆菌蛋白抗原表位 |
| |
引用本文: | 李江英,白雪娟,梁艳,张俊仙,阳幼荣,赵卫国,吴雪琼.用DNAStar软件预测Rv1410c结核分枝杆菌蛋白抗原表位[J].细胞与分子免疫学杂志,2015(4):474-477. |
| |
作者姓名: | 李江英 白雪娟 梁艳 张俊仙 阳幼荣 赵卫国 吴雪琼 |
| |
作者单位: | 河北北方学院;解放军第309医院全军结核病研究所全军结核病防治重点实验室 |
| |
基金项目: | 国家重大传染病防治科技重大专项基金(2012ZX10003008002);军队医学科技“十二五”重点项目(BWS11J050);北京市科技创新基地培育与发展工程专项(Z141107004414021) |
| |
摘 要: | 目的预测Rv1410c结核分枝杆菌(MTB)的抗原表位。方法利用DNAStar软件包中Editseq软件将Rv1410c MTB氨基酸序列进行编辑保存,然后利用Protean软件进行氨基酸序列分析,预测Rv1410c MTB的二级结构、B细胞抗原表位及T细胞抗原表位,然后再用BLAST分析其与人类抗原表位的同源性。结果 Rv1410c具有丰富的二级结构,含有较多潜在的B细胞抗原肽表位,主要位于1~10、67~77、129~137、189~205、222~235、253~267、296~306、330~338、359~367、462~467、494~517氨基酸残基或其附近,这些区域基本上含有β转角结构,亲水性、表面可能性和柔韧性指数都较高;也含有较多潜在的T细胞表位,主要位于16~37、84~102、108~115、137~160、202~207、219~222、245~263、321~325、355~362、387~391、417~445、486~494氨基酸残基或其附近。结论 Rv1410c MTB既含有较多潜在的B细胞抗原表位,也含有较多潜在的T细胞抗原表位。
|
关 键 词: | 抗原表位 DNAStar软件 结核分枝杆菌 Rv1410c 二级结构 |
本文献已被 CNKI 等数据库收录! |
|