人类PPARγ基因5′-非翻译区转录调控序列生物信息学分析 |
| |
引用本文: | 林绍鹏,魏伟民.人类PPARγ基因5′-非翻译区转录调控序列生物信息学分析[J].山西中医学院学报,2013(4):56-58. |
| |
作者姓名: | 林绍鹏 魏伟民 |
| |
作者单位: | [1]广州医科大学第二附属医院急诊科,广东广州510260 [2]增城市人民医院神经内科,广东增城511300 |
| |
基金项目: | [基金项目]广东省科技计划项目(20118061300004) |
| |
摘 要: | 目的:对人类PPARγ基因5′-非翻译区进行生物信息学的分析。方法:通过搜索网络数据库,得到PPARγ基因翻译起始点上游约2 kb的序列。运用PROMOTER SCAN分析该序列可能的启动子区域,利用在线分析软件EMBOSS、MethPrimer和CpG Island Searcher分析该序列潜在的CpC岛,运用TFSEARCH软件分析该序列潜在的转录因子结合位点。结果:人类PPARγ基因5′-非翻译区转录起始位点上游反向链2 425到2 175区具有启动子活性,在启动子上具有TATA盒。PPARγ基因5′-非翻译区转录起始位点上游2 kb序列存在包括MyoD、HSF和Nkx-2等19个转录因子的潜在结合位点,不存在CpG岛。结论:该实验为后续的PPARγ基因的转录调控研究奠定基础。
|
关 键 词: | 生物信息学 PPARγ 启动子 转录调控 |
本文献已被 维普 等数据库收录! |
|