| 采用分子动力学模拟探究VWF-A1突变体G561S的亲和力变化机制 |
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| 引用本文： | 李红,刘文平,刘广建,吴建华,方颖.采用分子动力学模拟探究VWF-A1突变体G561S的亲和力变化机制[J].医用生物力学,2015,30(5):433-439. |
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| 作者姓名： | 李红 刘文平 刘广建 吴建华 方颖 |
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| 作者单位： | 华南理工大学 生物科学与工程学院;华南理工大学 生物科学与工程学院;华南理工大学 生物科学与工程学院;华南理工大学 生物科学与工程学院;华南理工大学 生物科学与工程学院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（11272125，11432006，31170887） |
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| 摘 要： | 目的探究血管性血友病因子(von Willebrand factor,VWF)突变体G561S下调VWF-A1与其配体亲和力的分子机制。方法分别构建2M型突变体G561S-A1(功能减弱型)、WT-A1(野生型)和2B型突变体R543Q-A1(功能增强型)3个分子系统。G561S-A1突变体采用将野生型A1结构的Gly561替换为Ser561的方式构建,WT-A1与R543Q-A1晶体结构取自蛋白质数据库(protein data bank,PDB)。利用自由分子动力学模拟方法对比分析WT-A1、G561S-A1、R543Q-A1三者构象的改变、柔性的变化以及氢键/盐桥的形成与演化。结果 G561S突变通过降低A1结构域α2螺旋的柔性,并增强N末端与body区的相互作用从而减弱其与配体GPIbα的亲和力,R543Q功能增强型突变体则启动了一条相反的调节路径。结论局部动力学性质的改变是A1亲和力调控的潜在机制,研究结果有助于针对激活的A1结构域的变构药物设计以及相关抗血栓药物的研发。
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| 关 键 词： | 血管性血友病因子 亲和力 分子动力学 |
| 收稿时间： | 2015/4/20 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2015/5/20 0:00:00 |
Mechanism of affinity alterations in VWF-A1 domain mutant G561S studied by molecular dynamics simulation |
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| LI Hong,LIU Wen-ping,LIU Guang-jian,WU Jian-hua and FANG Ying.Mechanism of affinity alterations in VWF-A1 domain mutant G561S studied by molecular dynamics simulation[J].Journal of Medical Biomechanics,2015,30(5):433-439. |
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| Authors: | LI Hong LIU Wen-ping LIU Guang-jian WU Jian-hua and FANG Ying |
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| Institution: | School of Bioscience and Bioengineering, South China University of Technology;School of Bioscience and Bioengineering, South China University of Technology;School of Bioscience and Bioengineering, South China University of Technology;School of Bioscience and Bioengineering, South China University of Technology;School of Bioscience and Bioengineering, South China University of Technology |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | von Willebrand factor (VWF) Affinity Molecular dynamics |
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