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基于生物信息学数据分析ELTD1在肾透明细胞癌组织中的表达、甲基化水平及其临床意义
引用本文:黄逸婷,王珂,方晨. 基于生物信息学数据分析ELTD1在肾透明细胞癌组织中的表达、甲基化水平及其临床意义[J]. 中国肿瘤生物治疗杂志, 2022, 29(12): 1115-1124
作者姓名:黄逸婷  王珂  方晨
作者单位:1. 苏州大学附属第二医院 临床营养科,江苏 苏州 215004;2. 南京医科大学附属苏州 医院泌尿外科,江苏 苏州 215004
基金项目:国家自然科学基金资助项目(No.82070814)
摘    要:目的:探讨表皮生长因子蛛毒素受体7穿膜结构域蛋白1(ELTD1)在肾透明细胞癌(ccRCC)组织中的表达、甲基化水平及其与患者临床病理特征和预后的相关性。方法:通过公共数据库分析ccRCC组织中ELTD1表达和甲基化的差异水平,探讨ELTD1表达水平与患者临床病理特征和预后的相关性。通过TIMER2.0数据库评估ccRCC免疫细胞浸润,筛选ELTD1相关免疫检查点基因,进行GO功能和KEGG通路富集分析,通过基因共表达分析、筛选与ELTD1相关的基因。结果:与癌旁组织比较,ELTD1在ccRCC组织中呈高表达(P<0.05)。TCGA-KIRC队列中,ELTD1的甲基化水平与其表达呈负相关(R=-0.37,P<0.01)。ELTD1转录表达在ccRCC患者年龄、T分期、M分期、临床分期及病理分级组间存在显著差异(均P<0.01),且高表达ELTD1与较长的OS和PFS密切相关(HR=0.55、0.63,均P<0.01),ELTD1高表达是ccRCC的独立保护因素。ELTD1表达与B细胞、CD4+T细胞、CD8+T细胞、巨噬细胞和嗜中性粒细胞的免疫浸润呈显著负相关...

关 键 词:肾透明细胞癌  表皮生长因子蛛毒素受体7穿膜结构域蛋白1  甲基化  免疫浸润  预后标志物
收稿时间:2022-07-30
修稿时间:2022-11-06

Analysis of expression, methylation, and clinical significance of ELTD1 in clear cell renal cell carcinoma based on bioinformatics
HUANG Yiting,WANG Ke,FANG Chen. Analysis of expression, methylation, and clinical significance of ELTD1 in clear cell renal cell carcinoma based on bioinformatics[J]. Chinses Journal of Cancer Biotherapy, 2022, 29(12): 1115-1124
Authors:HUANG Yiting  WANG Ke  FANG Chen
Affiliation:1. Department of Clinical Nutrition, the Second Affiliated Hospital of Soochow University, Suzhou 215004, Jiangsu, China; 2. Department of Urologyical Surgery, Suzhou Hospital Affiliated to Nanjing Medical University, Suzhou 215004, Jiangsu, China
Abstract:
Keywords:clear cell renal cell carcinoma (ccRCC)   epidermal growth factor   latrophilin and seven transmembrane domain-containing 1 (ELTD1)   methylation   immune infiltration   prognostic marker
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