抗ADAR1锤头状核酶的计算机设计及其可控真核表达载体的构建 |
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引用本文: | 王海芳,罗晓星,王立锋,扈本荃.抗ADAR1锤头状核酶的计算机设计及其可控真核表达载体的构建[J].第四军医大学学报,2003,24(17):1569-1571. |
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作者姓名: | 王海芳 罗晓星 王立锋 扈本荃 |
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作者单位: | 1. 第四军医大学基础部,药理学教研室,陕西,西安,710033 2. 第四军医大学基础部,生物化学与分子生物学教研室,陕西,西安,710033 |
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摘 要: | 目的:选择针对ADAR1 mRNA的5’非编码区(NCR)和翻译起始区的锤头状核酶(ribozyrme,Rz)切割位点,构建针对ADAR1的Rz可诱导真核表达载体,旨在knock down ADAR1基因,开展ADAR1基因功能的研究.方法:应用计算机辅助设计,根据能量最低化原理,以ADAR1 mRNA的5’NCR和翻译起始区为靶序列,预测其二级结构,选择理想的Rz切割位点,设计并合成锤头状核酶.采用亚克隆法首先将人工合成的Rz DNA序列插入原核载体p1.5的XbaI和KpnI位点获得Rz原核表达质粒pRz-613;再将pRz-613中ADAR1Rz基因连同其两端的自剪切Rz序列一起克隆入可诱导真核表达载体pTRE的SacⅡ和EcoRI位点得到真核表达质粒pRz—ADAR1;通过酶切电泳和测序检查质粒重组后序列情况.结果:选出ADAR1 mRNA的第208位为Rz切点,设计并合成了RzDNA序列.所构建的pRz—ADAR1经酶切电泳鉴定显示,插入Rz序列大小约为180kb,和预期结果相同;经测序证实Rz序列正确.结论:利用计算机辅助设计,成功构建了针对ADAR1锤头状Rz可诱导真核表达载体pRz—ADAR1.
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关 键 词: | RNA编辑酶 锤头状核酶 计算机辅助设计 真核表达载体 |
文章编号: | 1000-2790(2003)17-1569-03 |
修稿时间: | 2003年5月15日 |
Computer design of hammerhead ribozyme targeting ADAR1 mRNA and construction of its inducible eukaryotic expression plasmid |
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Abstract: | |
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Keywords: | ADAR1 hammerhead ribozyme computer assisted design eukaryotic expression vector |
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