糖尿病模型大鼠血液microRNA的表达特征及生物信息学分析 |
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引用本文: | 李浩经,王丽媛,颉彦鹏,李森渊,王彤,蔡萧君.糖尿病模型大鼠血液microRNA的表达特征及生物信息学分析[J].山西医科大学学报,2024(4):473-479. |
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作者姓名: | 李浩经 王丽媛 颉彦鹏 李森渊 王彤 蔡萧君 |
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作者单位: | 1. 黑龙江省中医药科学院内分泌科;2. 黑龙江中医药大学附属第一医院眼科;3. 山西医科大学基础医学院 |
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基金项目: | 黑龙江省博士后基金面上项目(LBH-Z22269); |
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摘 要: | 目的 筛选2型糖尿病(T2DM)大鼠与正常大鼠血液中差异表达的microRNA(miRNA),通过生物信息学分析预测差异miRNA调控的靶基因及功能。方法 取20只健康雄性SD大鼠随机分为空白对照组和T2DM模型组,每组10只。采用高脂饲料联合腹腔注射链脲佐菌素(STZ)制作T2DM大鼠模型,2周后提取糖尿病大鼠及正常大鼠全血,应用miRNA测序技术筛选差异miRNA。利用生物信息学方法对差异表达的miRNA靶基因进行基因本体(gene ontology, GO)和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)通路富集分析。结果 与空白对照组相比,T2DM模型组大鼠随机血糖均≥16.7 mmol/L且明显升高、持续稳定。与空白对照组相比,T2DM模型组大鼠血液中共有56个差异表达的miRNA,其中32个上调,24个下调。GO富集分析显示差异表达miRNA的靶基因主要集中在细胞质、细胞核、细胞膜等细胞组分,DNA及RNA的转录调控等生物学过程,与蛋白结合、金属离子结合、ATP结合等分子功能相关。KEGG通路富集分析显示差异表达miRNA的靶基因...
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关 键 词: | 糖尿病 miRNA 生物信息学分析 基因本体 KEGG |
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