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基于Oncomine和GEO数据库分析SIRPα基因在乳腺癌中的表达意义以及丹参酚酸B的干预作用研究
引用本文:李丹,余涛,曾智,叶鹏,吴杰,沈秉正.基于Oncomine和GEO数据库分析SIRPα基因在乳腺癌中的表达意义以及丹参酚酸B的干预作用研究[J].现代药物与临床,2018,33(5):1013-1018.
作者姓名:李丹  余涛  曾智  叶鹏  吴杰  沈秉正
作者单位:武汉大学人民医院药学部;华中科技大学同济医学院附属武汉中心医院中西结合肿瘤科
基金项目:国家自然科学基金资助项目(81704023、81602535);湖北省卫计委中西医结合科研一般项目(23);武汉市卫计委科研项目(WZ15Z07)
摘    要:目的通过挖掘Oncomine和GEO基因芯片数据库中的相关数据,分析信号调节蛋白α(SIRPα)基因在乳腺癌中的表达及其临床意义,并探讨丹参酚酸B对乳腺癌细胞中SIRPα基因的干预作用。方法检索Oncomine和GEO数据库中有关乳腺癌和丹参酚酸B干预乳腺癌的数据集,对所获取的数据资料进行数据挖掘,并结合文献资料综合分析。考察丹参酚酸B作用于乳腺癌MCF7细胞的基因表达谱。结果对Oncomine数据库中共收集的9项关于乳腺癌和乳腺正常组织SIRPα基因有差异表达的研究数据进行分析,发现乳腺癌组织中SIRPα基因的表达明显低于乳腺正常组织,差异具有统计学意义(P0.05)。通过生存分析发现低表达SIRPα基因乳腺癌患者无病生存期明显差于高表达者,高表达患者的预后更好(P0.05)。通过挖掘GEO数据库中的数据集GSE85871发现丹参酚酸B能够上调乳腺癌细胞SIRPα基因的表达(P0.01)。结论SIRPα基因在乳腺癌组织中呈现低表达,并与乳腺癌患者的预后相关,该基因可能是丹参酚酸B干预乳腺癌细胞的一个新靶点。

关 键 词:丹参酚酸B  乳腺癌  SIRPα基因  数据挖掘
收稿时间:2018/2/22 0:00:00
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