第二代测序技术在一中国先天性白内障家系致病基因检测中的应用 |
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引用本文: | 肖海,张卉,李涛,吴东,张朝阳,时伟丽,秦利涛,廖世秀. 第二代测序技术在一中国先天性白内障家系致病基因检测中的应用[J]. 眼科研究, 2015, 33(8) |
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作者姓名: | 肖海 张卉 李涛 吴东 张朝阳 时伟丽 秦利涛 廖世秀 |
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作者单位: | 450003,郑州大学人民医院 河南省人民医院 河南省医学遗传研究所 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目,河南省科技厅科技发展项目 |
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摘 要: | 背景 某些遗传性疾病具有高度遗传异质性,因此传统的Sanger测序技术已经不能满足医学研究及临床工作的需求.第二代测序(NGS)技术由于具有费用低及检测速度快的优点而得到广泛应用,但在先天性眼病突变基因的检测中的应用效果有待验证.目的 探讨NGS技术对先天性白内障患者进行致病基因诊断和产前诊断的可行性.方法 于2013年1月收集来自河南省洛阳市的一汉族先天性白内障家系,抽取家系中3例患者(Ⅱ2、Ⅲ3、Ⅲ4)和3名表型正常者(Ⅱ3、Ⅲ1、Ⅲ2)的外周血各2 ml,EDTA抗凝,在河南省医学遗传研究所应用NGS技术对先证者进行基因突变位点检测,并采用Sanger测序技术对NGS结果进行验证,然后用Sanger测序技术对该家系其他成员的外周血样本进行突变位点的序列分析,根据确定的致病突变位点对先证者的胎儿进行产前诊断.本研究遵循赫尔辛基宣言,检测方案经河南省人民医院医学伦理委员会批准,所有研究对象均签署知情同意书.结果 该家系4代14位成员中共5例患者,其中男2例,女3例,分布于Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ代中,其他家系成员表型正常,符合常染色体显性遗传方式.NGS检测发现先证者Ⅲ3CRYBB1基因第6外显子上存在c.682T>C(p.S228P)杂合突变,Sanger法验证了该点突变.Sanger法检测发现家系中患者均存在CRYBB1基因c.682 T>C突变,而家系中表型正常者CRYBB1基因的c.682位点基因型为T/T野生型.产前诊断结果显示胎儿(Ⅳ1)CRYBB1基因c.682位点基因型为T/T野生型.结论 NGS可用于先天性白内障基因突变的快速检测,该家系致病性基因为CRYBB1基因c.682T>C突变,应用NGS技术结合一代测序技术成功对先证者进行了产前诊断.
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关 键 词: | 先天性白内障 家系谱 基因突变 DNA测序分析方法 第二代测序 产前诊断 |
Application of next-generation sequencing in detection of mutation gene in a Chinese pedigree with congenital cataract |
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Abstract: | |
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Keywords: | Cataract/congenital Pedigree Mutation DNA Sequence analysis Next-generation sequencing Prenatal diagnosis |
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