| 我国HIV-1主要流行株外膜蛋白(env)基因V3～V4区变异及其与生物学特性的关系 |
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| 引用本文： | 邢辉,梁浩,洪坤学,魏民,赵全壁,冯毅,陈建平,全宇,滕涛,邵一鸣.我国HIV-1主要流行株外膜蛋白(env)基因V3～V4区变异及其与生物学特性的关系[J].中华微生物学和免疫学杂志,2005,25(3):185-189. |
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| 作者姓名： | 邢辉 梁浩 洪坤学 魏民 赵全壁 冯毅 陈建平 全宇 滕涛 邵一鸣 |
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| 作者单位： | 1. 100050,北京,中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防控制中心
2. 广西医科大学公共卫生学院 |
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| 基金项目： | 国家杰出青年资金项目 ( 3992 5 0 30 )，国家“十五”科技攻关项目 ( 2 0 0 1BA70 5B0 2 ) |
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| 摘 要： | 目的 研究我国HIV 1主要流行毒株亚型的envV3～V4区变异与生物学特性的关系。方法 应用nested PCR对 1 57份获自我国 1 2个省份的HIV 1毒株env区序列进行扩增 ,并使用ABI 377型测序仪测序 ,然后应用BLAST、GCG和MEGA等生物学软件或程序对env基因V3～V4区序列进行分析。结果 B′亚型毒株V3顶端四肽存在着 4种类型 :GPGR ( 54% )、GPGQ ( 2 8% )、GPGK( 1 6 % )和GPGA( 2 % ) ,B′/C重组毒株全部为GPGQ( 1 0 0 % ) ,CRF0 1 AE重组毒株呈现GPGQ( 95% )和GPGR( 5% )两种类型 ;B′/C和CRF0 1 AE重组毒株V3～V4区及其临近区域N 糖基化位点比B′亚型毒株N 糖基化位点保守。而B′亚型毒株V3环的净电荷分别显著高于B′/C和CRF0 1 AE毒株 (P <0 .0 1 ) ;根据V3环关键氨基酸推测辅助受体使用情况的结果显示 :B′亚型毒株有 9.2 6 %可能使用CCR5,7.4 1 %可能使用CXCR4 ,其余 83.33%不能对辅助受体的使用作出预测。所有B′/C重组毒株被预测可能使用CCR5。CRF0 1 AE重组毒株有 90 .4 8%被预测可能使用CCR5,没有被预测为使用CXCR4的序列 ,9.52 %不能作出预测。结论 B′亚型毒株大部分可能为NSI型 ,少部分可能为SI型 ,而B′/C和CRF0 1 AE重组毒株绝大部分为NSI型。我国主要流行株的V3～V4区尤其是V3环的氨基酸
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| 关 键 词： | 生物学特性 流行株 外膜蛋白 基因 nested-PCR N-糖基化位点 HIV-1毒株 亚型毒株 CXCR4 可能使用 CCR5 辅助受体 氨基酸变异 enu V3环 流行毒株 方法应用 功能限制 重组 预测 序列 GCG I型 测序 NS |
| 修稿时间： | 2004年8月17日 |
The potential relationship between variation in the env V3-V4 region of HIV-1 predominant strains in China and virus biological feature |
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| XING Hui,LIANG Hao,HONG Kun-xue,WEI Min,ZHAO Quan-bi,FENG Yi,CHEN Jian-ping,QUAN Yu,TENG Tao,SHAO Yi-ming.The potential relationship between variation in the env V3-V4 region of HIV-1 predominant strains in China and virus biological feature[J].Chinese Journal of Microbiology and Immunology,2005,25(3):185-189. |
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| Authors: | XING Hui LIANG Hao HONG Kun-xue WEI Min ZHAO Quan-bi FENG Yi CHEN Jian-ping QUAN Yu TENG Tao SHAO Yi-ming |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Human immunodeficiency virus type 1 Subtype Phenotype Genetic variation |
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